员工因自身疾病在工作时死亡，用人单位是否需要赔偿，主要取决于疾病是否与工作有关、是否构成工伤以及用人单位是否为员工缴纳了相关社会保险等因素。以下是对这一问题的详细分析：
一、视同工伤的情况及赔偿
视同工伤的条件：
- 根据《工伤保险条例》第十五条第一款第（一）项规定，职工在工作时间和工作岗位，突发疾病死亡或者在48小时之内经抢救无效死亡的，视同工伤。
- 这意味着，如果员工在工作时间和工作岗位上突发疾病，并立即死亡，或者在48小时之内经抢救无效死亡，那么这种情况将被视为工伤。
赔偿项目及标准：
- 丧葬补助金：6个月的统筹地区上年度职工月平均工资。
- 供养亲属抚恤金：按照职工本人工资的一定比例发给由因工死亡职工生前提供主要生活来源、无劳动能力的亲属。具体比例根据亲属关系和实际情况确定。
- 一次性工亡补助金：上一年度全国城镇居民人均可支配收入的20倍。
二、非工伤情形下的赔偿责任
疾病与工作无关且非在工作时间和工作岗位突发：
- 如果员工的疾病是自身固有的，与工作环境、工作强度等均无关联，且不是在工作时间和工作岗位上突发的，那么这种情况通常不被视为工伤。
- 在这种情况下，用人单位在法律上没有必须进行赔偿的义务。但出于人道主义考虑，部分用人单位可能会提供一定的经济援助或补偿，如支付丧葬补助费、一次性救济金等，这通常基于地方规定或单位规章制度。
用人单位未缴纳社保的责任：
- 如果用人单位未依法为员工缴纳工伤保险费，而员工被认定为视同工伤（尽管在非工伤情形下这一认定不成立，但此处为全面分析而提及），或者员工因病或非因工死亡后，其遗属无法享受相应的社会保险待遇，那么用人单位可能需要在应享受的保险待遇范围内承担赔偿责任。
- 此外，如果用人单位未缴纳社保，还可能面临其他法律责任，如被劳动行政部门处罚等。
三、用人单位可能承担的其他责任
- 过错责任：
- 如果用人单位存在过错，如工作安排不合理导致员工过度劳累诱发疾病死亡，或工作场所存在有害因素影响员工健康，员工家属可根据具体情况要求用人单位承担相应的民事赔偿责任。
- 这需要根据证据和法律规定来判断用人单位的过错程度及赔偿比例。例如，如果用人单位能够证明其已尽到合理的管理和照顾义务，那么其赔偿责任可能会相应减轻。
四、实际建议
对于员工家属：
- 如果员工因自身疾病在工作时死亡，家属应首先了解员工是否满足视同工伤的条件。
- 如果满足条件，家属可以向用人单位或社会保险机构申请工伤保险待遇。
- 如果不满足条件，家属可以与用人单位协商，看是否能够获得一定的经济援助或补偿。
- 如果认为用人单位存在过错，家属可以收集证据并考虑通过法律途径维护自己的权益。
对于用人单位：
- 用人单位应加强社会保险缴纳意识，确保员工权益得到充分保障。
- 在工作安排上，用人单位应合理规划员工的工作时间和工作量，避免员工过度劳累。
- 在工作场所管理上，用人单位应确保工作场所的安全和卫生条件符合相关标准，减少员工因工作环境导致的健康问题。
综上所述，员工因自身疾病在工作时死亡时，用人单位的赔偿责任并非一成不变，而是需根据多种因素综合判断。如果员工满足视同工伤的条件，那么用人单位需要承担相应的工伤保险责任；如果不满足条件，那么用人单位的赔偿责任将取决于其是否存在过错以及其他相关因素。因此，在实际操作中，建议双方积极沟通协商，并咨询专业律师的意见以妥善处理相关事宜。如果你有进一步的法律问题，可以直接向我咨询。