结论：员工带薪休年假三天后直接不来上班，用人单位是否需要支付工资，需根据具体情况来判断。

分析如下：

1. 如果员工是合法享受带薪年休假：

   • 根据《职工带薪年休假条例》和《企业职工带薪年休假实施办法》的规定，员工在带薪年休假期间，用人单位应当按照员工正常工作期间的工资收入支付工资。
   • 因此，如果员工是合法享受带薪年休假，并且已经按照规定程序申请并获得了批准，那么员工在休假的三天内，用人单位应当支付工资。
   • 员工休假结束后直接不来上班，若属于无故旷工，用人单位可以根据规章制度进行处理，但这并不影响之前带薪年休假期间工资的支付。

2. 如果员工未按照规定程序申请带薪年休假或不符合享受条件：

   • 如果员工未按照用人单位的规章制度或相关法律法规的规定程序申请带薪年休假，或者员工并不符合享受带薪年休假的条件（如未连续工作满一年等），那么员工擅自休假可能构成旷工。
   • 在这种情况下，用人单位有权根据规章制度对员工进行处理，包括但不限于扣发工资、警告、解除劳动合同等。但具体处理方式需依据用人单位的规章制度和相关法律法规来确定。
   • 特别提醒：即使员工擅自休假构成旷工，用人单位在处理时也应遵循合法、合理、公正的原则，不得随意扣发员工工资或解除劳动合同。

3. 关于后续工资支付问题：

   • 如果员工在带薪年休假结束后直接不来上班，并且用人单位决定与其解除劳动合同或采取其他处理措施，那么对于员工未出勤的期间（即旷工期间），用人单位通常不需要支付工资。
   • 但是，如果员工之后返回工作岗位或用人单位决定继续留用员工，那么对于员工正常出勤的期间，用人单位应当按照劳动合同约定支付工资。

建议：

• 用人单位应建立健全的规章制度，明确带薪年休假的申请、审批、享受条件等事项，以及旷工的处理方式。
• 员工在享受带薪年休假前，应按照规定程序向用人单位提出申请，并获得批准。
• 如果员工在带薪年休假结束后直接不来上班，用人单位应及时与员工沟通了解情况，并根据规章制度和相关法律法规进行处理。

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