结论：跟公司签了工资支付协议后，是否还可以去仲裁办要赔偿金，这取决于协议的具体内容以及是否存在其他符合仲裁申请条件的情形。以下从不同角度进行分析：
协议内容明确且已履行：
- 如果工资支付协议中明确规定了公司应支付的工资数额、支付时间等关键条款，并且公司已经按照协议内容完全履行了支付义务，那么在这种情况下，你再去仲裁办申请赔偿金可能缺乏事实依据，仲裁机构可能不会支持你的请求。
协议内容存在争议或未完全履行：
- 如果工资支付协议中的某些条款存在争议，比如工资数额计算方式不明确、支付时间模糊等，或者公司并未按照协议内容完全履行支付义务，比如只支付了部分工资、延迟支付等，那么在这种情况下，你仍然有权向仲裁办申请仲裁，要求公司支付剩余的工资或承担违约责任等。此时，仲裁机构会根据协议内容、双方提供的证据以及相关法律法规进行裁决。
存在其他符合仲裁申请条件的情形：
- 除了工资支付问题外，如果还存在其他与劳动关系相关的争议，比如公司未依法为你缴纳社会保险费、未提供劳动保护或劳动条件等，且这些争议符合仲裁申请的条件（如属于仲裁机构受理范围、在仲裁时效内等），那么你仍然可以向仲裁办申请仲裁，要求公司承担相应的法律责任。
法律建议：
- 在决定是否申请仲裁前，建议你先仔细审查工资支付协议的内容，确认公司是否已经完全履行了协议义务。
- 如果协议内容存在争议或公司未完全履行义务，或者存在其他符合仲裁申请条件的情形，你可以收集相关证据（如协议文本、工资支付记录、工作证明等），并向当地的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请。
- 在仲裁过程中，你需要积极配合仲裁机构的工作，提供必要的证据和陈述，以维护自己的合法权益。
可能法律后果：
- 如果仲裁机构认定你的请求有理有据，可能会裁决公司支付你相应的工资或赔偿金等。
- 如果仲裁机构认定你的请求缺乏事实依据或不符合仲裁申请条件，可能会驳回你的仲裁申请。此时，如果你对裁决结果不服，还可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。