结论：公司规定夫妻两人不能在同一科室并要求调离一方，这一规定是否违法不能一概而论，需结合具体情况分析。

分析如下：

1. 从劳动合同和公司规章制度的角度：

   • 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中并未明确规定夫妻不能在同一科室工作，那么公司单方面作出这样的规定并要求调离一方，可能构成对劳动合同的变更，需要双方协商一致。
   • 公司规章制度是公司为了维护正常生产经营秩序、保障员工权益而制定的内部规范。如果公司规章制度中明确规定了夫妻不能在同一科室工作，并且这一规定不违反法律法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么公司有权依据规章制度要求调离一方。但前提是，该规章制度必须经过民主程序制定，并且已经向员工公示或告知。

2. 从反就业歧视的角度：

   • 根据相关法律法规，劳动者享有平等就业和选择职业的权利，不因民族、种族、性别、宗教信仰等不同而受歧视。虽然夫妻关系不属于上述明确列举的歧视情形，但如果公司仅因夫妻关系就限制员工的工作岗位选择，可能构成对员工平等就业权的侵犯，尤其是在没有合理理由的情况下。

3. 从实际操作和合理性的角度：

   • 公司可能出于避免利益冲突、提高工作效率等考虑而制定这样的规定。然而，这些理由是否充分、合理，需要具体问题具体分析。例如，如果夫妻双方在同一科室工作确实存在利益冲突或影响工作效率的情况，且公司已经采取了其他措施（如岗位隔离、利益申报等）仍无法解决，那么公司要求调离一方可能具有一定的合理性。

建议：

• 如果您认为公司的规定侵犯了您的合法权益，您可以先与公司进行沟通协商，表达您的诉求和理由。
• 如果沟通无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，寻求法律援助和保护。
• 在处理此类问题时，建议您保留好相关证据（如劳动合同、公司规章制度、沟通记录等），以便在需要时提供证明。

后续行动：

• 如果您需要更具体的法律建议或帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供个性化的法律解决方案。