一个单位不同科室之间的借调行为，本身并不直接构成违法。不过，是否违法需结合具体情况和相关法律法规来综合判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 劳动合同与岗位约定

• 劳动合同内容：首先，需要查看员工与单位签订的劳动合同中，是否对工作岗位、工作地点等有明确约定。如果劳动合同中明确规定了员工应在特定科室或岗位工作，那么未经员工同意的借调可能违反劳动合同约定。
• 岗位变更程序：根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位变更劳动合同内容（如工作岗位、工作地点等），应当与劳动者协商一致，并采用书面形式。因此，如果借调行为未经员工同意，且未遵循法定程序，可能构成违法。

2. 借调的合法性与合理性

• 单位内部管理：单位内部因工作需要进行的借调，如果符合单位规章制度，且未对员工造成不利影响（如降低工资、改变工作条件等），通常被认为是合法的。
• 员工权益保护：借调过程中，单位应确保员工的合法权益不受侵害，包括但不限于工资待遇、工作环境、职业发展机会等。如果借调导致员工权益受损，员工有权提出异议。

3. 特殊情况下的借调

• 临时借调：对于临时性的借调，如果单位能够证明借调的必要性，并且借调期限合理，同时保障了员工的合法权益，那么这种借调行为通常是合法的。
• 长期借调：对于长期借调，尤其是跨部门、跨岗位的借调，单位应更加谨慎地处理。长期借调可能涉及劳动合同的变更，需要遵循更严格的法律程序。

4. 法律后果与风险防范

• 法律后果：如果借调行为违反了劳动合同或相关法律法规，员工有权要求单位承担相应的法律责任，包括但不限于恢复原岗位、赔偿损失等。
• 风险防范：为避免法律风险，单位在进行借调前应与员工充分沟通，确保借调行为符合法律法规和单位规章制度，并签订书面借调协议，明确双方的权利和义务。

建议与总结

• 对于单位：在进行借调时，应确保借调行为的合法性和合理性，遵循法定程序，保障员工的合法权益。
• 对于员工：如果遇到未经同意的借调或借调过程中权益受损的情况，应及时与单位沟通协商，必要时可寻求法律援助。

总结来说，一个单位不同科室之间的借调行为本身并不违法，但需结合具体情况和相关法律法规来综合判断。如果借调行为违反了劳动合同或相关法律法规，或者对员工造成了不利影响，那么这种借调行为就可能构成违法。因此，在进行借调时，单位和员工都应谨慎处理，确保借调行为的合法性和合理性。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。