结论：加班工资的计算基数，一般应以劳动合同中约定的工资标准为准，但若劳动合同中约定的工资标准低于实际发放的基本工资，且该基本工资是劳动者正常工作时间的固定收入，那么应以实际基本工资作为加班工资的计算基数。
详细分析：
劳动合同约定优先原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。劳动合同中约定的工资标准，通常是双方协商一致的结果，具有法律效力。
- 如果劳动合同中明确约定了加班工资的计算基数，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，那么应按照劳动合同的约定执行。
实际发放工资作为参考：
- 在实际操作中，如果劳动合同中约定的工资标准低于劳动者实际发放的基本工资，且该基本工资是劳动者在正常工作时间内能够获得的固定收入，那么该基本工资更能够反映劳动者的实际劳动价值。
- 在这种情况下，如果仍然按照劳动合同中约定的较低工资标准计算加班工资，显然对劳动者不公平。因此，应以实际基本工资作为加班工资的计算基数。
加班工资的计算方法：
- 加班工资的计算通常基于加班时间和加班工资的计算基数。加班时间包括工作日加班、休息日加班和法定节假日加班，不同情况下的加班工资计算比例可能不同。
- 假设以实际基本工资7500元作为加班工资的计算基数，那么加班工资的计算公式可以表示为：加班工资 = 加班时间 × (7500元 / 21.75天 / 8小时) × 加班工资计算比例（其中21.75天是月平均工作天数，8小时是日平均工作时间，加班工资计算比例根据加班类型确定，如工作日加班为150%，休息日加班为200%，法定节假日加班为300%）。
特殊情况下的处理：
- 如果劳动合同中约定的工资标准包含奖金、津贴等浮动部分，而这些部分并非劳动者在正常工作时间内能够获得的固定收入，那么在计算加班工资时，可能不应将这些浮动部分纳入计算基数。
- 另外，如果用人单位与劳动者在劳动合同中明确约定了加班工资的计算基数，且该约定高于实际发放的基本工资，那么应按照约定执行，但前提是该约定不违反法律、行政法规的强制性规定。
建议：
- 劳动者在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资和加班工资的约定，确保自己的权益得到保障。
- 如果发现劳动合同中约定的工资标准低于实际发放的基本工资，或者加班工资的计算方式存在不公平之处，应及时与用人单位沟通协商，必要时可以寻求法律援助或提起劳动争议仲裁。
- 用人单位也应遵守相关法律法规，合理约定工资和加班工资的计算方式，避免引发劳动争议和法律风险。
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