结论：在施工总承包单位将工程分包给有资质的劳务公司，但劳务公司拖欠农民工工资的情况下，责任主要由劳务公司承担，但施工总承包单位也可能需要承担一定的责任，具体取决于实际情况和法律规定。
分析说明：
劳务公司的直接责任：
- 劳务公司作为直接雇佣农民工的单位，与农民工之间形成了劳动关系或雇佣关系。根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳务公司有义务按时足额支付农民工的工资。
- 如果劳务公司拖欠农民工工资，农民工有权向劳务公司追讨，并可以通过法律途径维护自己的权益，如向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等。
施工总承包单位的潜在责任：
- 根据《保障农民工工资支付条例》等相关规定，施工总承包单位对所承包工程项目的农民工工资支付负总责。这意味着，即使施工总承包单位已经将工程分包给有资质的劳务公司，它仍然需要对农民工工资的支付情况进行监督和管理。
- 如果施工总承包单位未履行对劳务公司支付农民工工资的监督义务，或者存在其他违法行为（如未将人工费用及时足额拨付至农民工工资专用账户等），导致农民工工资被拖欠，施工总承包单位可能需要承担相应的法律责任，包括但不限于被责令限期清偿、加付赔偿金、受到行政处罚等。
特殊情况下的责任划分：
- 如果劳务公司具备合法资质，且施工总承包单位已经按照合同约定将人工费用拨付至农民工工资专用账户，但劳务公司仍然拖欠农民工工资，那么责任主要应由劳务公司承担。
- 如果劳务公司不具备合法资质，或者施工总承包单位存在违法分包、转包等行为，导致农民工工资被拖欠，那么施工总承包单位可能需要承担更大的责任，甚至可能与劳务公司承担连带责任。
行动建议：
- 对于农民工：如果遭遇工资被拖欠的情况，首先应向劳务公司追讨，并保留好相关证据（如劳动合同、工资条、工作记录等）。如果劳务公司拒绝支付或无力支付，可以向施工总承包单位反映情况，并要求其协助解决。同时，也可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
- 对于施工总承包单位：应加强对劳务公司的管理和监督，确保劳务公司按时足额支付农民工工资。同时，应建立健全的工资支付保障制度，如设立农民工工资专用账户、实行工资代发制度等，以降低工资拖欠的风险。如果发生工资拖欠事件，应积极配合相关部门进行调查和处理，并承担相应的法律责任。
法律后果：
- 如果劳务公司或施工总承包单位违反相关法律法规规定，拖欠农民工工资，可能会面临行政处罚（如罚款、责令停业整顿等）、民事赔偿（如加付赔偿金、支付拖欠的工资及利息等）以及刑事责任（如拒不支付劳动报酬罪等）等法律后果。
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