结论前置：合作合同按劳动关系实施是否违法，取决于双方关系的实质。若双方实际存在劳动关系而未签订劳动合同，仅签订合作合同，则违法；若双方为合作关系且明确约定，则不违法。
一、合作合同与劳动合同的核心区别
主体关系：
- 合作合同：双方为平等的民事主体，地位平等，以合作为基础，共同承担风险，共享收益。
- 劳动合同：用人单位与劳动者之间存在管理与被管理的关系，劳动者需遵守用人单位的规章制度，接受其管理。
内容差异：
- 合作合同：主要规定合作事项中的权利与义务，如合作方式、收益分配、风险承担等。
- 劳动合同：明确工作内容、劳动报酬、工作时间、休息休假等劳动者权益，以及用人单位的管理职责。
法律适用：
- 合作合同：主要受民法调整，遵循平等、自愿、公平、诚实信用的原则。
- 劳动合同：受劳动法、劳动合同法规范，保护劳动者的合法权益，规范用人单位的用工行为。
二、判断合作合同按劳动关系实施是否违法的标准
劳动关系特征明显时违法：
- 当一方提供劳动，接受另一方的管理和监督，且劳动是单位业务的组成部分，单位定期支付报酬，此时双方实际存在劳动关系。根据《中华人民共和国劳动合同法》第十条，应订立书面劳动合同。若仅签订合作合同而未签订劳动合同，则违法，可能面临向劳动者支付双倍工资或视为订立无固定期限劳动合同的法律后果。
- 举例：张某在某公司工作，接受公司的管理和监督，从事公司业务范围内的工作，公司定期支付工资。若张某与公司仅签订合作合同而未签订劳动合同，则公司违法。
合作关系合法时无需劳动合同：
- 若双方为平等的民事主体，基于合作项目开展合作，各自独立承担责任，不存在管理与被管理关系，则签订合作合同即可，无需劳动合同。例如，双方合作开发软件，各自负责不同部分，按约定分享成果和承担风险。
- 举例：李某和王某合作开发一款手机应用，李某负责编程，王某负责设计，双方按约定分享收益和承担风险。此时，双方签订合作合同即可，无需签订劳动合同。
三、实践中的判断依据与建议
- 在实践中，判断双方关系的性质需综合考虑实际行为、协议条款等因素。若对关系性质有争议，可通过劳动仲裁或司法程序进行认定。
- 对于用人单位：若与劳动者建立劳动关系，应依法签订劳动合同，以保障劳动者合法权益，避免法律风险。同时，在签订合作合同时，应明确双方关系性质，避免误导劳动者或产生法律纠纷。
- 对于劳动者：在签订合作合同时，应仔细阅读合同条款，了解双方关系性质及自身权益。若发现用人单位存在违法行为或侵害自身权益的情况，应及时向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
四、法律后果
- 若用人单位未依法签订劳动合同而按劳动关系实施合作合同，可能面临向劳动者支付双倍工资、视为订立无固定期限劳动合同等法律后果。同时，还可能受到劳动监察部门的处罚。
- 若双方为合作关系而签订合作合同，则无需承担劳动合同法下的法律责任。但若合作合同存在违法条款或侵害第三方权益的情况，仍可能面临法律纠纷和赔偿责任。
总结与建议：合作合同按劳动关系实施是否违法，需根据双方关系的实际情况和协议内容来判断。在签订合同时，双方应明确关系性质及各自权益，避免产生法律纠纷。若有问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况为你提供专业的法律建议。