结论前置：签合作协议而不签劳动合同是否违法，取决于双方关系的实质。若双方实际存在劳动关系而未签订劳动合同，则违法；若双方为合作关系且明确约定，则不违法。
一、合作协议与劳动合同的核心区别
主体关系：
- 合作协议：双方为平等的民事主体，地位平等，合作的基础是共同的目标或利益，不存在管理与被管理的关系。
- 劳动合同：则明确规定了用人单位与劳动者之间的管理与被管理关系，劳动者需遵守用人单位的规章制度，接受其管理。
内容差异：
- 合作协议：主要规定合作事项中的权利与义务，如合作方式、收益分配、风险承担等，更侧重于合作的具体内容和方式。
- 劳动合同：则详细明确了工作内容、劳动报酬、工作时间、休息休假等劳动者权益，以及用人单位的义务和责任。
法律适用：
- 合作协议：主要受民法调整，遵循平等、自愿、公平、诚实信用的原则。
- 劳动合同：则受劳动法、劳动合同法规范，这些法律对劳动者的权益保护更为严格。
二、判断签合作协议不签劳动合同是否违法的标准
劳动关系特征明显时违法：
- 当一方提供劳动，接受另一方的管理和监督，且劳动是单位业务的组成部分，单位定期支付报酬时，双方实际存在劳动关系。根据《中华人民共和国劳动合同法》第十条，应订立书面劳动合同。未签订则违法，用人单位可能面临向劳动者支付双倍工资或视为订立无固定期限劳动合同的法律后果。例如，若员工在单位长期从事固定工作，接受单位的管理和考核，并领取固定工资，此时即使签订的是合作协议，也可能被认定为劳动关系，从而构成违法。
合作关系合法时无需劳动合同：
- 若双方为平等的民事主体，基于合作项目开展合作，各自独立承担责任，不存在管理与被管理关系，则签订合作协议即可，无需劳动合同。例如，双方合作开发软件，各自负责不同部分，按约定分享成果和承担风险，此时签订合作协议是合法的。
三、实践中的判断依据与建议
- 在实践中，判断双方关系的性质需综合考虑实际行为、协议条款等因素。若对关系性质有争议，可通过劳动仲裁或司法程序进行认定。
- 对于用人单位：若与劳动者建立劳动关系，应依法签订劳动合同，以保障劳动者合法权益，避免法律风险。即使双方希望以合作形式进行，也应明确劳动关系与合作关系之间的界限，避免模糊处理导致法律纠纷。
- 对于劳动者：在签订协议时，应仔细阅读协议条款，明确自己的权益和义务。若发现协议内容与实际工作情况不符，或存在被管理、被监督的情况，应及时与用人单位沟通并要求签订劳动合同。
- 对于合作者：应明确合作关系的本质，确保合作协议内容合法、有效。在合作过程中，应保持独立性，避免与对方形成管理与被管理的关系。
四、法律依据
- 《中华人民共和国劳动合同法》第十条：建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。
- 《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第六条：用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当依照劳动合同法第八十二条的规定向劳动者每月支付两倍的工资，并与劳动者补订书面劳动合同。
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