结论：签合作协议而不签劳动合同是否违法，取决于双方关系的实质。若双方实际存在劳动关系而未签订劳动合同，则违法；若双方为合作关系且明确约定，则不违法。以下是对这一问题的详细分析：
一、合作协议与劳动合同的核心区别
主体关系：
- 合作协议：双方为平等的民事主体，地位平等，以合作为基础，不存在管理与被管理的关系。
- 劳动合同：用人单位与劳动者之间存在管理与被管理的关系，劳动者需遵守用人单位的规章制度。
内容差异：
- 合作协议：主要规定合作事项中的权利与义务，如合作方式、收益分配、风险承担等。
- 劳动合同：明确工作内容、劳动报酬、工作时间、休息休假、社会保险等劳动者权益。
法律适用：
- 合作协议：主要受民法调整，遵循平等、自愿、公平、诚实信用的原则。
- 劳动合同：受劳动法、劳动合同法规范，用人单位需承担更多的法律责任，如支付加班费、提供劳动保护等。
二、判断签合作协议不签劳动合同是否违法的标准
劳动关系特征明显时违法：
- 当一方提供劳动，接受另一方的管理和监督，且劳动是单位业务的组成部分，单位定期支付报酬时，双方实际存在劳动关系。根据《中华人民共和国劳动合同法》第十条，应订立书面劳动合同。未签订则违法，用人单位可能面临向劳动者支付双倍工资或视为订立无固定期限劳动合同的法律后果。
- 例子：小张在某公司担任销售员，接受公司的管理和监督，按照公司的要求完成销售任务，公司定期支付工资。此时，小张与公司之间实际存在劳动关系，应签订劳动合同。若公司仅与小张签订合作协议，则违法。
合作关系合法时无需劳动合同：
- 若双方为平等的民事主体，基于合作项目开展合作，各自独立承担责任，不存在管理与被管理关系，则签订合作协议即可，无需劳动合同。
- 例子：小李和小王合作开发一款软件，小李负责编程，小王负责设计，双方按约定分享成果和承担风险。此时，小李和小王之间为合作关系，签订合作协议即可，无需劳动合同。
三、实践中的判断依据
- 在实践中，判断双方关系的性质需综合考虑实际行为、协议条款等因素。若对关系性质有争议，可通过劳动仲裁或司法程序进行认定。劳动仲裁机构或法院会根据双方的实际行为、协议内容、行业惯例等因素进行综合判断。
四、总结与建议
对于用人单位：
- 若与劳动者建立劳动关系，应依法签订劳动合同，以保障劳动者合法权益，避免法律风险。
- 在签订合作协议时，应明确双方关系的性质，避免将劳动关系误认为合作关系，从而引发法律纠纷。
对于劳动者：
- 应积极要求用人单位及时签订书面的劳动合同，并在合同中明确双方的权利和义务关系。
- 若遇到用人单位拒绝签订劳动合同的情况，可以向当地的劳动监察部门进行投诉或举报，以寻求法律援助和维护自己的合法权益。
对于合作者：
- 应明确合作关系的本质，确保合作协议内容合法、有效，以维护自身权益。
- 在签订合作协议前，应仔细阅读协议条款，了解双方的权利和义务，避免产生不必要的纠纷。
最后，若你在工作或合作中遇到类似问题，或有其他法律疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。