结论：工作不在规定时间内完成就扣绩效是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 劳动合同或公司规章制度有明确规定：

   • 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了工作任务的完成时间以及未按时完成时的绩效扣减措施，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照这些规定扣减绩效是合法的。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三条，订立劳动合同，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。依法订立的劳动合同具有约束力，用人单位与劳动者应当履行劳动合同约定的义务。同时，根据《中华人民共和国劳动法》第四十七条，用人单位根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。这意味着，在合法合规的前提下，公司有权通过规章制度来管理员工的工作绩效和薪酬。

2. 劳动合同或公司规章制度无明确规定，或规定违法：

   • 如果劳动合同或公司规章制度中没有明确规定工作任务的完成时间以及未按时完成时的绩效扣减措施，或者这些规定违反了法律法规的强制性规定（如最低工资标准、加班工资支付等），那么公司扣减绩效的行为可能是违法的。
   • 法律后果：在这种情况下，劳动者有权向公司提出异议，并要求公司纠正违法行为。如果公司拒绝纠正，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径维护自己的合法权益。

3. 扣减绩效的合理性：

   • 即使劳动合同或公司规章制度中有明确规定，公司在扣减绩效时也需要考虑扣减的合理性。例如，如果员工未按时完成工作是由于不可抗力因素（如自然灾害、突发疾病等）导致的，那么公司扣减绩效可能显得不合理。
   • 建议：公司在制定和执行绩效扣减制度时，应当充分考虑员工的实际情况和合理诉求，确保制度的公平性和合理性。同时，公司也应当加强与员工的沟通和协商，共同营造一个和谐、稳定的劳动关系。

进一步思考：

• 作为劳动者，在签订劳动合同时，应当仔细阅读合同条款，特别是关于工作任务、完成时间以及绩效扣减等方面的规定。如果发现合同中有不合理或违法的条款，应当及时向公司提出异议，并要求公司进行修改。
• 作为公司，在制定和执行规章制度时，应当遵循法律法规的强制性规定，确保制度的合法性和合规性。同时，公司也应当注重员工的感受和需求，通过合理的薪酬制度和激励机制来激发员工的工作积极性和创造力。

总结：工作不在规定时间内完成就扣绩效是否合法，取决于劳动合同或公司规章制度的规定以及这些规定的合法性和合理性。如果遇到相关问题，建议劳动者和公司都积极寻求法律途径来解决争议，维护自己的合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。