孕妇在劳动仲裁中可以主张的赔偿主要包括以下几个方面：
违法解除劳动合同的赔偿金：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资、予以辞退、与其解除劳动或者聘用合同。如果用人单位违法解除了与孕妇的劳动合同，孕妇有权要求用人单位支付违法解除劳动合同的赔偿金。赔偿金的标准通常是按照孕妇在用人单位的工作年限，每满一年支付两个月工资的标准来计算。
未支付或未足额支付工资的赔偿：
- 孕妇在怀孕期间，用人单位应当按时足额支付工资。如果用人单位未支付或未足额支付工资，孕妇可以要求用人单位支付拖欠的工资，并可能根据具体情况要求支付一定的经济补偿或赔偿金。
未缴纳社会保险的赔偿：
- 用人单位应当为孕妇缴纳社会保险，包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险。如果用人单位未缴纳或未足额缴纳社会保险，孕妇可以要求用人单位补缴社会保险，并可能根据具体情况要求支付一定的经济补偿。特别是生育保险，对于孕妇来说至关重要，它涵盖了生育医疗费用和生育津贴等，如果用人单位未缴纳，孕妇可能因此遭受经济损失。
加班费及未休年假的补偿：
- 孕妇在怀孕期间，如果加班或未休年假，用人单位应当按照法律规定支付加班费或给予相应的补偿。如果用人单位未支付加班费或未给予年假补偿，孕妇可以要求用人单位支付相应的费用。
其他因用人单位违法行为导致的损失赔偿：
- 如果用人单位的其他违法行为（如侮辱、体罚、殴打、非法搜查或者拘禁孕妇等）给孕妇造成了损失，孕妇也有权要求用人单位进行赔偿。
在申请劳动仲裁时，孕妇需要注意以下几点：
- 收集证据：孕妇需要收集与用人单位存在劳动关系、用人单位违法行为以及自身损失相关的证据，如劳动合同、工资条、考勤记录、医疗证明等。
- 及时申请：劳动仲裁有一定的时效限制，孕妇应当在知道或应当知道自己的权益受到侵害之日起一年内申请劳动仲裁。
- 寻求专业帮助：虽然孕妇可以自己申请劳动仲裁，但考虑到劳动仲裁的专业性和复杂性，建议孕妇在申请前咨询专业律师，以更好地维护自己的权益。
举例说明：
假设孕妇小李在怀孕期间被用人单位违法解除了劳动合同，且用人单位未支付她最后一个月的工资和未缴纳社会保险。在这种情况下，小李可以向劳动仲裁机构申请仲裁，要求用人单位支付违法解除劳动合同的赔偿金、拖欠的工资以及补缴社会保险。如果小李能够提供充分的证据证明用人单位的违法行为和自己的损失，那么她的仲裁请求很可能会得到支持。
最后，如果孕妇在劳动仲裁过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议和帮助。