针对您提出的“楼顶种菜要怎么处罚”这一问题，首先需要明确的是，楼顶种菜本身并不直接对应一个具体的“处罚”措施，而是需要根据具体情况，由相关部门依据其职责范围采取相应的管理或纠正措施。以下是我为您详细梳理的解答：
一、楼顶种菜可能涉及的问题
楼顶种菜可能涉及改变建筑物外观、影响市容市貌、违反城市规划、破坏防水结构引发房屋安全隐患等多方面问题。这些问题不仅可能影响小区的整体环境和居民的生活质量，还可能对房屋的安全造成潜在威胁。
二、相关部门的管理职责与行动方式
物业管理部门：
- 职责：物业有义务维护小区公共区域的秩序和环境卫生，楼顶作为小区公共区域的一部分，物业应负责管理。
- 行动方式：业主可以向物业管理处反映情况，物业应出面与种菜业主沟通，要求其整改，恢复楼顶的正常使用状态。如果物业未能有效解决问题，业主可以进一步向相关部门投诉。
城市管理综合行政执法部门（城管部门）：
- 职责：城管部门负责城市规划、市容环境卫生的监督管理，楼顶种菜可能涉及违反城市规划等问题。
- 行动方式：若物业管理部门未能有效解决问题，或所在区域无物业管理，业主可以向城管部门投诉。城管部门有权依法查处，责令种菜者停止违法行为并进行清理。
社区居委会：
- 职责：社区居委会有责任协调处理社区内居民间的矛盾和问题，促进邻里和谐。
- 行动方式：业主可以向居委会投诉，居委会工作人员会介入调解，通过温和的方式促使种菜业主认识到行为的不妥，并主动改正。
房屋管理部门（住建局相关科室）：
- 职责：住建局负责房屋建筑工程质量、物业行业的监管，楼顶种菜可能破坏防水结构，引发房屋安全隐患。
- 行动方式：业主可以向住建局相关科室反映楼顶种菜引发的房屋安全问题，由其督促相关责任方进行处理，确保房屋的安全和正常使用。
三、投诉与举报的注意事项
- 在向各部门投诉时，业主应提供详细的证据和情况说明，如拍照、录像等，以便相关部门更好地了解问题并采取相应措施。
- 如果以上途径均无法解决问题，业主可以考虑向更高层级的管理部门或政府热线进行举报，寻求更进一步的帮助和支持。
四、关于“处罚”的说明
需要强调的是，楼顶种菜本身并不直接对应一个具体的“处罚”措施。相关部门在接到投诉后，会根据具体情况进行调查核实，并依据相关法律法规和管理规定采取相应的管理或纠正措施。这些措施可能包括责令整改、清理、罚款等，但具体处罚措施需由相关部门根据实际情况依法决定。
综上所述，面对楼顶种菜的问题，业主应依据相关法律法规和管理规定，通过合法的途径进行投诉和举报。同时，也建议各相关部门加强协作，共同解决这类问题，为居民创造一个安全、整洁、和谐的居住环境。