针对您提出的“房顶种菜违规怎么处理”的问题，这是一个涉及小区公共区域管理、法律法规以及业主权益的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、明确房顶种菜的违规性
房顶，作为小区公共区域的一部分，其使用和管理通常受到小区管理规约和物业服务合同的约束。在大多数情况下，房顶种菜是违反小区规定的，因为它可能改变建筑物的外观、影响市容市貌，甚至破坏防水结构，引发房屋安全隐患。此外，根据《物业管理条例》等相关法律法规，小区公共绿地属于全体业主共有，单个业主不能随意改变其用途，因此房顶种菜也侵犯了其他业主的合法权益。
二、处理房顶种菜的步骤
友好沟通与劝阻：
- 首先，您可以尝试与种菜的业主进行友好沟通，提醒其行为违反了小区规定，并可能对小区环境和其他业主造成不良影响。
- 如果沟通效果不佳，您可以请求物业管理部门或业主委员会介入，与种菜业主进行进一步的交流，劝其自行清理菜地。
发出书面整改通知：
- 若口头沟通无效，物业管理部门可以根据小区管理规约和相关规定，向种菜业主发出书面整改通知。
- 整改通知应明确指出其行为违反了小区规定，并限定整改期限。同时，告知逾期不整改将采取的进一步措施及可能面临的后果。
报告相关部门：
- 若业主拒绝整改或逾期未整改，物业管理部门应向相关行政管理部门（如城市管理综合行政执法部门、房屋管理部门等）报告。
- 这些部门有权依法进行查处，责令种菜者停止违法行为并进行清理，以维护城市的整体规划和市容，以及房屋的安全和正常使用。
强制清理与法律诉讼：
- 在取得业主委员会的支持以及确保程序合法的前提下，若业主仍拒不整改，物业管理部门可以组织人员对菜地进行强制清理。
- 若业主的行为严重损害了其他业主的权益，且通过协商和行政手段无法解决问题，受害业主还可以选择向法院提起民事诉讼，要求侵权业主承担法律责任。
三、投诉与举报的注意事项
- 在向各部门投诉时，您应提供详细的证据和情况说明，如拍照、录像等，以便相关部门更好地了解问题并采取相应措施。
- 若以上途径均无法解决问题，您可考虑向更高层级的管理部门或政府热线进行举报，寻求更进一步的帮助和支持。
四、预防与教育
- 为了预防类似行为的再次发生，物业管理部门或业主委员会应加强小区内的法制宣传和教育工作。
- 通过定期举办法律知识讲座、发放宣传资料等方式，提高业主的法律意识和公共意识，让业主了解小区管理的相关规定和法律法规，增强其遵守规定的自觉性。
综上所述，处理房顶种菜问题需要遵循法律法规和管理规定，通过友好的沟通、书面的整改通知、相关部门的报告以及必要的强制措施和法律诉讼等手段来综合施策。同时，也应加强预防和教育，提高业主的法律意识和公共意识，共同维护小区的和谐与秩序。