业主在楼顶种菜可能违反以下相关法规：

1. 《中华人民共和国民法典》：

   • 根据《民法典》第二百七十四条，建筑区划内的绿地（除非属于城镇公共绿地或明示属于个人）属于业主共有。楼顶作为建筑区划的一部分，其使用应遵循共有部分的管理规定。业主未经其他业主同意，在楼顶种菜可能侵犯了全体业主的共同利益，构成对他人合法权益的侵害。其他业主有权要求种菜者停止侵害、恢复原状，并可能要求赔偿损失。

2. 《物业管理条例》：

   • 《物业管理条例》规定，业主应遵守管理规约，不得擅自改变物业使用性质或占用公共区域。楼顶作为小区的公共区域，其使用应受到物业管理规约的约束。业主在楼顶种菜改变了楼顶的使用性质，违反了物业管理条例的相关规定。物业公司有权要求业主进行整改，恢复楼顶的原状，以维护小区的整体环境和公共秩序。

3. 城市绿化管理相关法规：

   • 许多城市有专门的城市绿化管理条例，如《北京市绿化条例》等，明确禁止擅自占用城市绿化用地。小区内的绿地，包括楼顶绿化（如果属于规划内的绿化部分），属于城市绿化的一部分。业主在楼顶种菜属于擅自改变绿化用地用途的违法行为，城市绿化行政主管部门有权责令停止并恢复原状，还可能处以罚款。

4. 《城乡规划法》：

   • 公共区域是规划用于公共服务等特定用途的土地。业主私自在楼顶种菜可能改变了土地用途，违反了《城乡规划法》中关于土地用途规划的规定。根据该法，未经批准擅自改变土地用途进行种植的，土地管理部门有权责令退还非法占用的土地，并限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施。

5. 《城市市容和环境卫生管理条例》：

   • 业主在楼顶种菜可能破坏公共区域的整洁和美观，影响小区的整体居住环境。这违反了《城市市容和环境卫生管理条例》中关于维护城市市容和环境卫生的规定。相关部门可责令其纠正违法行为，采取补救措施，并可处以罚款。

法律建议与后果：

• 法律建议：业主在享受小区公共资源的同时，应务必遵守相关法律法规和物业管理规定。如果希望在楼顶进行绿化或种植活动，建议先咨询物业公司或业主委员会，了解相关规定和程序，确保自己的行为合法合规。

• 可能后果：如果业主未经允许擅自在楼顶种菜，可能面临其他业主的投诉、物业公司的整改要求、城市绿化行政主管部门的处罚等。在严重情况下，还可能涉及民事赔偿或行政处罚等法律责任。

综上所述，业主在楼顶种菜可能涉及多个法律层面的违规。为了维护小区的和谐与管理秩序，避免不必要的法律纠纷和后果，建议业主在行动前充分了解相关政策并遵守规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。