结论：员工因手术病假影响考核是否违法，需根据具体情况判断，主要看公司考核制度是否合法合理以及是否对病假员工进行了不公平对待。

详细分析：

1. 考核制度的合法性：

   • 公司的考核制度应当合法、合理，且经过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会或职工代表协商等），并向员工公示或告知。如果考核制度本身存在违法或不合理之处，比如对病假员工设置不合理的考核标准，那么以此为基础的考核结果可能不具备合法性。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。

2. 病假员工的考核处理：

   • 员工因手术病假属于法定医疗期内的休假，公司应当按照法律规定支付病假工资，并不得因此解除劳动合同。在考核时，公司应当考虑病假对员工工作表现的影响，避免对病假员工进行不公平的考核。
   • 如果公司无视员工的病假情况，仍然按照正常出勤的标准进行考核，并因此降低员工的绩效评分或奖金等，这种做法可能构成违法。因为公司没有考虑到员工因病假导致的无法正常工作的情况，对员工进行了不公平的对待。
   • 实践建议：公司可以在考核制度中明确规定病假期间的考核处理方式，比如病假期间不参与绩效考核、病假期间绩效评分按一定比例折算等，以确保考核的公平性和合理性。

3. 具体案例分析：

   • 假设某公司规定，员工病假期间不参与绩效考核，且病假期间的工资按照法定标准支付。在这种情况下，员工因手术病假影响考核是合法的，因为公司已经考虑了病假对员工工作表现的影响，并做出了合理的处理。
   • 反之，如果某公司规定，员工病假期间仍然需要参与绩效考核，且病假期间的绩效评分与正常出勤时相同。在这种情况下，如果员工因病假导致无法正常工作，而公司仍然按照正常出勤的标准进行考核，并因此降低了员工的绩效评分或奖金等，这种做法就可能构成违法。

总结与建议：

• 公司应当制定合法、合理的考核制度，并确保该制度经过民主程序制定、公示或告知员工。
• 在考核时，公司应当考虑病假对员工工作表现的影响，避免对病假员工进行不公平的考核。
• 如果员工认为公司的考核制度或考核处理方式存在违法或不合理之处，可以向公司提出异议或向劳动监察部门投诉。
• 如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。