结论：员工请假未跟店长说而直接跟老板说，这一行为是否合规以及后续处理方式，主要取决于公司的规章制度以及老板和店长的具体授权情况。以下是从不同角度进行的分析：
一、公司规章制度的角度
规章制度内容：
- 公司通常会有明确的请假制度，规定员工请假应遵循的流程，包括向谁请假、如何请假、请假需要哪些手续等。
- 如果规章制度中明确规定员工请假需向店长报告，而员工未遵循此规定，则可能构成违规。
违规后果：
- 根据规章制度的严重程度和违规情节，公司可能会对员工进行警告、扣薪、甚至解除劳动合同等处理。
- 但具体处理方式还需考虑违规的严重性、员工的历史表现、公司文化等因素。
二、老板和店长授权的角度
授权情况：
- 如果老板明确授权店长负责员工的日常管理和请假审批，那么员工应向店长请假。
- 如果老板未明确授权，或者老板直接表示可以接受员工的请假申请，那么员工直接向老板请假可能并不违规。
实际处理：
- 在实际操作中，如果老板接受了员工的请假申请，并且没有对此提出异议，那么可以认为老板默认了这一请假行为。
- 但为了避免后续纠纷，建议员工在请假时尽量遵循公司规定的流程，即使直接向老板请假，也应事后告知店长或补办相关手续。
三、建议与措施
对于员工：
- 在请假前，应仔细阅读公司的规章制度，了解请假流程和要求。
- 如果不确定应向谁请假，可以咨询人力资源部门或上级领导。
- 尽量避免直接跨级请假，以免给管理带来混乱。
对于公司：
- 应制定明确、合理的请假制度，并确保员工知晓并遵守。
- 对于员工的违规行为，应依据规章制度进行公正、合理的处理。
- 可以加强员工培训，提高员工对规章制度的认知度和遵守意识。
后续思考依据：在处理此类问题时，公司应综合考虑规章制度、授权情况、员工表现等多方面因素，做出公正、合理的决策。同时，员工也应增强法律意识，遵守公司规章制度，维护良好的劳动关系。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。