针对您提出的企业女员工50周岁时干部身份和工人身份认定不清的问题，这确实是一个涉及员工切身利益的重要事项。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，干部和工人身份的认定应当依据个人招工原始档案的记载来进行。档案中能体现职工身份的原始材料，如招工表、转正定级表、岗位变动记录等，都是认定身份的重要依据。因此，解决身份认定不清问题的第一步，就是查阅并核实这些原始档案材料。
接下来，关于企业女职工的退休年龄问题，这确实与身份认定密切相关。根据相关规定，女干部和女工人的法定退休年龄分别为年满55周岁和50周岁。但这里有一个重要的前提，那就是退休年龄是按其退休前的岗位来确定的。具体来说，如果女工人退休前在干部管理岗位上连续工作满五年及其以上的，可以按55周岁退休；反之，如果女干部退休前在工人岗位上连续工作满五年以上的，则可以按50周岁退休。
此外，随着时代的发展，干部身份的作用在不断地弱化。人社部门已经不再办理转正定级手续，也不再负责认定或证明干部身份。对于女职工岗位的认定，现在主要是以用人单位与劳动者签订的劳动合同为依据。不论原身份是工人还是干部，其现岗位应以劳动合同中确定的岗位为准。凡在现岗位工作一年以上，均应以现岗位认定其身份，并据此确定退休年龄。
针对您提出的具体问题，如果企业女员工在50周岁时面临干部身份和工人身份认定不清的情况，我建议采取以下步骤：
查阅原始档案：首先，应查阅员工的个人招工原始档案，核实其中关于身份认定的相关材料。
核实劳动合同：其次，要核实员工与用人单位签订的劳动合同，确定其现岗位性质。
咨询相关部门：如果仍有疑问或争议，可以咨询当地的人社部门或劳动仲裁机构，了解具体的政策规定和操作流程。
根据规定办理：最后，根据核实的结果和相关的政策规定，为员工办理相应的退休手续。如果员工符合按工人岗位办理退休的条件，且本人愿意提前退休，还可以填写《企业女干部（管理岗）申请按工人岗位办理退休的声明》，并按照规定程序办理变更手续。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。