关于农民工工资拖欠欠条由总包还是分包开具的问题，这主要取决于实际的欠薪主体和具体情况，以下分情况讨论：
如果欠薪主体是分包单位：
- 在大多数情况下，农民工是与分包单位直接建立劳动关系的，因此，如果欠薪是由分包单位造成的，那么欠条应当由分包单位开具。分包单位作为直接雇主，有责任和义务支付农民工的工资，并在拖欠工资时出具欠条作为凭证。
如果欠薪主体是总包单位或涉及总包单位的责任：
- 在某些情况下，总包单位可能因分包单位的管理问题、资金问题或自身原因而承担连带责任。如果总包单位直接参与了欠薪行为，或者根据相关法律法规、合同约定需要承担支付农民工工资的责任，那么欠条也可以由总包单位开具。
- 特别是当分包单位无力支付或逃匿时，总包单位可能需要根据《保障农民工工资支付条例》等相关规定，先行清偿农民工工资，此时欠条由总包单位开具是合理的。
特殊情况下的处理：
- 如果存在多层分包或转包的情况，欠薪责任可能更加复杂。在这种情况下，需要仔细审查合同条款、相关法律法规以及实际欠薪情况，以确定欠条应由哪个单位开具。
- 有时，为了保障农民工的权益，相关部门或法院可能会要求总包单位和分包单位共同出具欠条或承担连带责任。
法律建议：
- 明确欠薪主体：首先，要明确欠薪的具体主体是谁，是分包单位还是总包单位，或者是两者都有责任。
- 收集证据：在要求开具欠条之前，农民工应尽可能收集与欠薪相关的证据，如工作记录、工资单、合同等，以便在需要时证明自己的权益。
- 协商与调解：在明确欠薪主体后，可以尝试与欠薪单位进行协商或寻求相关部门的调解，以尽快解决欠薪问题。
- 法律途径：如果协商和调解无果，农民工可以通过法律途径来维护自己的权益，如向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等。
可能后果：
- 如果欠薪单位拒绝开具欠条或拒绝支付工资，农民工可能会面临维权困难的情况。此时，通过法律途径来维护自己的权益是必要的。
- 如果欠薪单位被证实存在违法行为，如恶意拖欠工资等，可能会面临法律制裁和行政处罚。
总之，农民工工资拖欠欠条的开具主体取决于实际的欠薪主体和具体情况。在处理此类问题时，建议农民工咨询专业律师或相关部门的意见，以确保自己的权益得到妥善保障。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的建议，可以直接向我咨询。