综合工时制下的加班工资倍数，主要取决于加班的具体情形，一般延长工作时间按150%支付加班费，法定节假日按300%支付加班费。以下是对这一问题的详细分析：
延长工作时间加班：
- 在综合计算周期内，如果劳动者的总实际工作时间超过总法定标准工作时间，那么超出的部分应被视为延长工作时间。
- 根据相关规定，延长工作时间的加班费应按照不低于劳动者本人小时工资标准的150%支付。计算公式为：加班费 = 小时工资标准 × 150% × 超出的小时数。
法定节假日加班：
- 无论采用何种工时制度，法定节假日安排劳动者工作的，都应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付加班费。计算公式为：加班费 = 日或小时工资标准 × 300% × 加班的天数或小时数。
关于“休息日”加班的特殊说明：
- 在综合工时制下，不存在像标准工时制那样单纯因为是“休息日”上班就支付2倍加班费的情况。因为综合工时制已经对工作时间进行了周期性综合计算，不再严格区分工作日和休息日。
- 然而，部分地区可能有特别规定。例如，某些地区规定，在综合计算周期内，如果劳动者的实际工作时间总数未超过该周期的法定标准工作时间总数，只是某一具体日（或周、月、季）超过法定标准工作时间，其超过部分不应视为延长工作时间；但若综合计算周期内工作时间超过法定标准工作时间，则超过部分按1.5倍支付加班费。
建议与注意事项：
- 劳动者在签订劳动合同时，应仔细阅读合同中关于工时制度和加班费支付的条款，确保自己的权益得到保障。
- 如果用人单位未按照规定支付加班费，劳动者有权向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
- 由于地区性法规和劳动合同的具体约定可能对加班费计算产生影响，因此在处理具体问题时，建议结合当地的相关规定和劳动合同的具体内容进行分析。
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