在综合工时制下，加班工资的计算确实是一个涉及多个方面的复杂问题，但我会尽量用清晰、有条理的方式为您解释清楚。

一、综合工时制的基本概念

综合工时制是一种特殊的工作时间制度，它以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间。在这种制度下，平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同，但在综合计算周期内，某一具体日或周的实际工作时间可以超过8小时或40小时，只要总实际工作时间不超过总法定标准工作时间即可。

二、加班工资的计算基础

1. 小时工资基数： 加班工资的计算基数是劳动者本人的小时工资。这个小时工资可以通过月工资收入除以月计薪天数（通常为21.75天）再除以8小时来得到。

2. 加班认定： 在综合计算周期内，劳动者实际工作时间超过法定标准工作时间的部分视为加班。如果某个具体日或周的工作时间超标，但综合计算周期内总工作时间未超标，则一般不视为加班。

三、加班工资的具体计算方法

1. 工作日延长工作时间加班： 如果劳动者在工作日延长了工作时间，那么加班工资应按照小时工资基数的150%来计算。计算公式为：加班工资 = 小时工资基数 × 150% × 延长工作小时数。

示例：假设某员工月工资为6000元，小时工资基数约为34.48元（6000元 ÷ 21.75天 ÷ 8小时）。如果他在某工作日延长了2小时工作，那么他的加班工资就是34.48元 × 150% × 2小时 = 103.44元。

1. 休息日加班： 在综合工时制下，休息日工作通常通过集中休息或轮休方式补偿。但如果无法安排补休，那么加班工资应按照小时工资基数的200%来计算。计算公式为：加班工资 = 小时工资基数 × 200% × 休息日加班小时数。

示例：如果上述员工在某休息日加班了8小时，且无法安排补休，那么他的加班工资就是34.48元 × 200% × 8小时 = 551.68元（但根据之前参考信息中的简化计算，若小时工资基数取30元，则加班工资为480元，这里我们采用更精确的计算方式）。

1. 法定节假日加班： 无论综合计算周期内的总工时是否超标，法定节假日工作都必须按照小时工资基数的300%来支付加班工资。计算公式为：加班工资 = 小时工资基数 × 300% × 法定节假日加班小时数。

示例：如果上述员工在某法定节假日加班了6小时，那么他的加班工资就是34.48元 × 300% × 6小时 = 620.64元（同样地，根据简化计算方式，若小时工资基数取35元，则加班工资为630元）。

四、注意事项

1. 证据保存： 劳动者应妥善保存加班证据，如考勤记录、工作记录等，以备劳动争议时使用。

2. 合同约定与企业规章制度： 用人单位与劳动者可在劳动合同中明确加班工资的计算方式，但不得违反法律法规的强制性规定。

3. 延长工作时间限制： 每月延长工作时间不得超过36小时，超时部分仍按150%计算加班工资。

4. 特殊行业规定： 特殊行业、企业和工作岗位可能实行不同的综合工时制规定，计算加班工资时需考虑当地实际情况和相关规定。

综上所述，综合工时制下的加班工资计算需要综合考虑多个因素，包括小时工资基数、加班类型以及综合计算周期内的总工时等。希望这个解释能帮助您更好地理解综合工时制下的加班工资计算方法。如果您还有其他问题或需要进一步的解释，请随时告诉我。