结论：公司车辆没过户只签了协议，出了事故后，处理方式需根据事故责任划分、协议具体内容以及车辆实际使用情况等多方面因素综合确定，一般有以下几种处理方向。

1. 事故责任在车辆使用方
   • 协议有明确约定：如果签订的协议中明确约定了在车辆使用过程中发生事故，责任由使用方承担，那么使用方需要按照协议约定，承担事故造成的全部损失，包括对第三方的人身伤害赔偿、财产损失赔偿等。例如，协议中写明“在车辆使用期间，因使用方原因导致的交通事故，由使用方承担全部法律责任及经济赔偿责任”，此时使用方就要依据此条款履行赔偿义务。
   • 协议无明确约定：即便协议没有明确约定事故责任承担，根据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的相关规定，车辆使用方作为实际控制车辆并导致事故发生的一方，通常需要承担主要或全部的赔偿责任。比如，使用方在驾驶过程中存在超速、酒驾等违法行为导致事故，那么使用方要为自己的侵权行为负责。不过，如果公司作为车辆所有权人，在车辆管理上存在过错，如明知车辆存在安全隐患仍交付使用方使用等，公司也可能需要承担相应的补充责任。
2. 事故责任在第三方
   • 无论协议如何约定，因第三方原因导致的事故，应由第三方承担赔偿责任。此时，车辆使用方和公司可以作为受害方，向第三方主张赔偿。例如，第三方违规变道与车辆发生碰撞，导致车辆受损以及车上人员受伤，那么第三方应承担全部的维修费用和人员伤亡赔偿费用。如果第三方拒绝赔偿或者无力赔偿，车辆使用方和公司可以根据自身投保的保险情况，向保险公司申请理赔。
3. 保险理赔方面
   • 车辆有保险：一般情况下，车辆会投保交强险和商业险。在事故发生后，应及时通知保险公司。保险公司会根据事故责任认定以及保险合同的约定进行理赔。如果事故责任在使用方，保险公司会在保险责任范围内对第三方的损失进行赔偿；如果责任在第三方，使用方和公司的损失可以由第三方的保险进行赔偿，若第三方无保险或保险不足，使用方和公司投保的车损险等商业险可能会发挥作用。但需要注意的是，如果车辆未过户，可能会在保险理赔时遇到一些麻烦，比如保险公司可能会以车辆信息与投保信息不符为由，拒绝理赔或者减少理赔金额。所以，在签订协议后，应及时办理车辆过户手续或者变更保险信息。
   • 车辆无保险：如果车辆没有投保任何保险，那么事故造成的损失就需要由责任方自行承担。如果是使用方的责任，使用方要承担全部赔偿；如果是第三方责任，第三方要承担赔偿，若第三方无力赔偿，使用方和公司可能就需要自行承担车辆损失以及车上人员的损失等。

在处理这类事故时，建议各方保留好相关证据，如事故现场照片、协议文本、事故责任认定书等，以便在后续的协商、调解或者诉讼过程中维护自己的合法权益。如果对事故处理存在疑问或者遇到困难，可以直接向我咨询。