针对您提出的“公司员工数年连续怀孕怎么处理”的问题，这主要涉及到女职工的劳动权益保护以及公司的人力资源管理策略。以下是我为您提供的详细解答：
首先，从法律法规的角度来看，女职工在孕期、产期和哺乳期内享有特殊的劳动保护。根据国家劳动总局保险福利司的相关规定，女职工按计划生育怀孕，经过医师开具证明需要保胎休息的，其保胎休息的时间应按照本单位实行的疾病待遇的规定办理。这意味着，女职工在保胎休息期间，应享受与病假相同的待遇。
进一步地，如果女职工的保胎休息和病假连续停止工作超过六个月后生育，她们可以从生育之日起停发疾病救济费，改发产假工资，并享受其他生育待遇。产假期满后仍需病休的，从产假期满之日起，继续发给疾病救济费。这一规定确保了女职工在生育期间的经济权益不受损害。
另外，关于劳动合同的处理，根据就业困难人员政策的相关规定，劳动合同期满时，如果女职工处于孕期、产期或哺乳期内，劳动合同应当续延至相应的情形消失时终止。这意味着，即使劳动合同到期，只要女职工处于这些特殊时期，公司就不能单方面终止劳动合同，否则将构成违法终止，女职工有权要求撤销公司的终止决定并恢复劳动关系。
针对您提到的“数年连续怀孕”的情况，虽然这可能给公司的人力资源管理带来一定的挑战，但公司仍应严格遵守相关法律法规，保障女职工的合法权益。公司可以通过以下方式来应对：
加强沟通与理解：与女职工进行充分的沟通，了解她们的需求和困难，提供必要的支持和帮助。
合理规划人力资源：根据公司的业务需求和女职工的实际情况，合理规划人力资源，确保公司的正常运营不受影响。
完善内部管理制度：建立健全的内部管理制度，明确女职工在孕期、产期和哺乳期的权益和待遇，以及公司在这些特殊时期的责任和义务。
提供必要的培训和发展机会：为女职工提供必要的培训和发展机会，帮助她们提升职业技能和竞争力，为公司的长期发展贡献力量。
综上所述，公司应严格遵守相关法律法规，保障女职工在孕期、产期和哺乳期的合法权益，并通过加强沟通、合理规划人力资源、完善内部管理制度以及提供必要的培训和发展机会等方式来应对女职工数年连续怀孕的情况。