如果工伤认定被行政诉讼推翻了，单位理论上可能会要求追回已支付的医疗费。但这个问题涉及多个层面，我们逐一分析：

1. 法律层面：

   • 工伤认定是劳动者享受工伤保险待遇的前提。一旦工伤认定被推翻，劳动者就不再具备享受工伤保险待遇的法律依据。
   • 单位已经支付的医疗费，是基于原有的工伤认定结果。如果这一认定被撤销，单位在法律上有权要求追回这部分费用。

2. 实际操作层面：

   • 单位是否会实际追回已支付的医疗费，还取决于其内部管理制度、财务状况以及与劳动者的关系等多种因素。
   • 有些单位可能会出于人道主义考虑，或者为了避免与劳动者产生进一步的纠纷，选择不追回已支付的费用。

3. 劳动者权益保护：

   • 如果工伤认定被推翻，劳动者应当积极寻求法律途径来维护自己的权益。例如，可以重新申请工伤认定，或者通过诉讼来争取自己的合法权益。
   • 在此过程中，劳动者可以咨询专业律师，了解自己的法律权利和应对策略。

综上所述，工伤认定被行政诉讼推翻后，单位理论上可能会要求追回已支付的医疗费。但实际操作中，这一行为受到多种因素的影响。劳动者应当密切关注自己的权益保护问题，并在必要时寻求法律帮助。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。