当您的工伤认定被公司通过行政复议推翻后，您可以采取以下步骤来维护自己的合法权益：

一、了解推翻原因及依据

首先，您需要仔细审查公司推翻工伤认定的具体原因及依据。这有助于您明确下一步的维权方向。如果公司给出的理由不充分或不合理，您有权要求公司进一步说明或提供证据。

二、向劳动保障行政部门提出异议

若您对公司的推翻决定不服，可以在规定时间内向作出工伤认定的劳动保障行政部门提出异议。在提出异议时，您应详细阐述自己认为应认定为工伤的理由和证据，要求行政部门重新审查工伤认定结果。

三、准备并提交相关证据

在提出异议的过程中，您需要积极收集并提交与工伤相关的证据。这些证据可能包括：

1. 就医记录：详细记录受伤时间、地点、症状、诊断等信息，以证明您的伤情与工作有关。
2. 证人证言：寻找现场目睹事故发生的同事或其他目击者，请他们提供证言以支持您的工伤主张。
3. 工作相关记录：如工作日志、任务分配记录等，以证明您在受伤时正在执行工作任务。

四、考虑行政复议或行政诉讼

如果劳动保障行政部门在重新审查后维持了公司的推翻决定，或者您对审查结果仍不满意，您可以考虑以下两种途径：

1. 行政复议：向作出认定决定的上一级行政机关提出复议申请，要求重新审查工伤认定结果。在复议过程中，您需要再次阐述自己的理由和证据。
2. 行政诉讼：如果行政复议结果仍未达预期，您可以依法提起行政诉讼。通过司法途径，由法院对工伤认定的合法性进行全面审查。在诉讼过程中，您需要积极准备充分的证据材料，以支持自己的工伤主张。

五、寻求法律援助或咨询

在整个维权过程中，如果您感到困惑或无力应对，可以寻求法律援助或咨询专业律师。他们可以为您提供专业的法律建议和指导，帮助您更好地维护自己的合法权益。

六、保持耐心和坚持

维权过程可能漫长且复杂，但请您保持耐心和坚持。通过合法途径争取自己的权益是每个人的权利，也是维护社会公平正义的重要体现。

总之，当您的工伤认定被公司通过行政复议推翻后，不要气馁或放弃。通过了解推翻原因、提出异议、准备证据、考虑行政复议或行政诉讼以及寻求法律援助等途径，您可以有效地维护自己的合法权益。