面对您在上班期间在公司被工友打伤并住院的情况，这是一个涉及法律权益和人身安全的重要问题，您需要依法、有序地采取以下措施来维护自己的合法权益：

一、立即采取紧急措施

1. 及时报警：首先，您应立即拨打110报警，详细说明事情经过和受伤情况，请求警方迅速介入调查。警方的调查记录和后续结果将是您后续处理的重要依据。

2. 紧急就医：同时，您应尽快前往医院接受治疗，确保自己的健康得到及时恢复。在治疗过程中，请务必妥善保存所有医疗记录、诊断证明、检查报告以及医疗费用票据等，这些将是您日后索赔和法律责任认定的关键证据。

二、进行伤情鉴定

在伤情稳定后，您应向公安机关申请法医鉴定。法医鉴定结果对于判断您的伤情程度、确定法律责任以及处理案件都至关重要。它将直接影响打人者可能面临的刑事责任和民事赔偿责任。

三、明确法律责任与维权途径

1. 刑事责任：

   • 如果经法医鉴定您的伤情为轻伤或重伤，打人者将涉嫌故意伤害罪，需要承担刑事责任。公安机关将对此立案处理，并依法追究其刑事责任。
   • 如果您的正当防卫行为明显超过必要限度并造成了重大损害，虽然您的初衷是为了制止不法侵害，但您也可能需要承担一定的刑事责任，不过通常会得到减轻或免除处罚。

2. 行政责任：

   • 如果经法医鉴定您的伤情为轻微伤，打人者的行为将违反《中华人民共和国治安管理处罚法》，公安机关可对其处以拘留和罚款。

3. 民事责任：

   • 无论您的伤情如何，您都有权要求打人者承担民事赔偿责任。赔偿范围包括您的医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。如果因伤导致残疾，您还可以要求赔偿残疾赔偿金等相关费用。

4. 单位责任：

   • 由于您是在单位因工作原因被打，单位也应承担一定的责任。您可以要求单位协助调查，提供证据，并根据具体情况要求单位给予相应的补偿或赔偿，如工伤待遇等。如果单位未尽到安全保障义务，可能还需承担补充赔偿责任。

四、依法维权

1. 协商赔偿：在明确法律责任后，您可以首先尝试与打人者进行协商，看是否能够达成赔偿协议。如果能达成协议，请务必通过书面方式确认并执行。

2. 提起民事诉讼：如果协商不成，您可以向法院提起民事诉讼，提交相关证据，由法院依法判决打人者承担相应的赔偿责任。

3. 刑事附带民事诉讼：如果打人者涉嫌刑事犯罪，您可以在公安机关立案后提起刑事附带民事诉讼，要求赔偿。

五、注意事项

• 在整个过程中，请务必保持冷静，依法行事，不要采取过激行为。
• 积极收集和固定证据，包括医疗记录、报警记录、监控录像、证人证言等，以支持自己的主张。
• 如果您对法律程序和维权途径不熟悉，可以寻求法律援助或委托专业律师提供帮助。

综上所述，面对此类情况，您应依法、有序地采取措施来维护自己的合法权益。通过明确法律责任、依法维权，并注重证据的收集和固定，您可以有效保护自身权益并争取到应有的赔偿。