结论：在合同中已约定仲裁条款的情况下，即便对方缺席，法院通常也不会直接判决，而是会驳回起诉，告知当事人向仲裁机构申请仲裁。不过，也存在一些特殊情况，法院可能会受理并作出判决。以下为你详细分析：

仲裁条款的效力及法院的一般处理原则

根据《中华人民共和国仲裁法》第五条规定，当事人达成仲裁协议，一方向人民法院起诉的，人民法院不予受理，但仲裁协议无效的除外。这意味着，如果合同中明确约定了仲裁条款，且该条款有效，那么当事人应当通过仲裁的方式解决纠纷，而不是向法院起诉。在这种情况下，即使对方缺席，法院也不会对案件进行实体审理并作出判决，而是会裁定驳回起诉，告知当事人向仲裁机构申请仲裁。

仲裁条款可能无效的情形

虽然仲裁条款具有排除法院管辖的效力，但也存在一些例外情况，即仲裁条款可能无效，此时法院可能会受理案件并作出判决。以下是一些常见的仲裁条款无效情形：

1. 约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围：例如，约定对婚姻、收养、监护、扶养、继承纠纷等不能仲裁的事项进行仲裁，这样的仲裁条款就是无效的。
2. 无民事行为能力人或者限制民事行为能力人订立的仲裁协议：由于这类主体缺乏相应的民事行为能力，他们订立的仲裁协议通常也是无效的。
3. 一方采取胁迫手段，迫使对方订立仲裁协议的：在这种情况下，受胁迫方可以请求法院确认仲裁协议无效。
4. 仲裁协议对仲裁事项或者仲裁委员会没有约定或者约定不明确，当事人又达不成补充协议的：此时，仲裁协议也可能被认定为无效。

对方缺席对案件处理的影响

在合同纠纷案件中，如果对方缺席，法院的处理方式会因案件是否属于法院管辖范围而有所不同。

1. 如果案件属于法院管辖范围（即仲裁条款无效）：法院会依法进行缺席审理，并根据查明的事实和证据作出判决。在这种情况下，缺席的一方可能会承担不利的法律后果，例如，如果其未能提供充分的证据来支持自己的主张，法院可能会判决其败诉。
2. 如果案件不属于法院管辖范围（即仲裁条款有效）：如前所述，法院会驳回起诉，告知当事人向仲裁机构申请仲裁。此时，对方缺席并不会影响法院对管辖权的判断。

实际建议

1. 仔细审查合同中的仲裁条款：在起诉前，务必仔细审查合同中的仲裁条款，确保其有效且明确。如果发现仲裁条款存在无效情形，可以考虑向法院起诉。
2. 及时与对方沟通：在起诉前或起诉过程中，尝试与对方进行沟通，了解其态度和意图。如果对方愿意通过协商或调解解决纠纷，这可能是一种更为高效和经济的解决方式。
3. 准备充分的证据：无论案件是通过仲裁还是诉讼解决，准备充分的证据都是至关重要的。这有助于支持自己的主张，并增加胜诉的可能性。

如果你在合同纠纷中遇到了类似问题，或者有其他任何法律疑问，都可以直接向我咨询。