结论：在合同中已约定仲裁条款的情况下，若一方拿着结算单向法院起诉且法院已经受理，法院是否会驳回起诉，取决于仲裁条款的效力及具体情形。一般来说，如果仲裁条款有效且符合法定条件，法院可能会驳回起诉；但如果存在仲裁条款无效等特殊情形，法院则可能继续审理。
分析如下：
仲裁条款的效力：
- 根据《中华人民共和国仲裁法》的相关规定，有效的仲裁条款应当具有明确的仲裁意思表示、仲裁事项以及选定的仲裁委员会。如果合同中的仲裁条款满足这些条件，那么它就是有效的，对双方当事人具有约束力。
- 如果仲裁条款存在瑕疵，如未明确选定仲裁委员会、仲裁事项不明确等，可能导致仲裁条款无效。此时，当事人可以向法院提起诉讼，法院也会受理。
法院受理后的处理：
- 如果仲裁条款有效，且一方在起诉前未向仲裁机构申请仲裁，而是直接向法院起诉，法院在受理案件后，如果发现存在有效的仲裁条款，且被告在首次开庭前提交仲裁协议，法院应当驳回起诉，告知当事人向仲裁机构申请仲裁。
- 如果被告在首次开庭前未对法院受理该案提出异议，或者虽然提出异议但仲裁条款被认定无效，或者当事人达成书面协议放弃仲裁条款的，法院将继续审理案件。
特殊情形：
- 如果仲裁条款因一方欺诈、胁迫等手段订立，或者仲裁事项超出法律规定的仲裁范围，仲裁条款可能被认定无效。此时，法院将不受仲裁条款的约束，继续审理案件。
- 另外，如果双方当事人在合同中约定了仲裁条款，但事后又达成书面协议放弃仲裁条款，选择诉讼解决纠纷的，法院也将受理并审理案件。
建议：
- 如果您是被告方，且认为合同中的仲裁条款有效，应当在首次开庭前向法院提出异议，并提交仲裁协议，要求法院驳回原告的起诉。
- 如果您是原告方，且认为合同中的仲裁条款无效或存在其他特殊情形，可以在起诉时向法院说明情况，并提供相关证据，以便法院作出正确判断。
- 在任何情况下，都建议您咨询专业律师，以便更准确地了解您的权利和义务，以及可能面临的法律后果。
后续行动：
- 如果您需要进一步的法律帮助或咨询，请随时向我提问，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。