法院在面对用人单位陈述与其提交的书证不一致的情况时，会综合全案证据进行审查判断，并根据证据的证明力大小来认定案件事实，进而作出相应裁定，具体如下：
证据审查原则：法院会遵循民事诉讼证据规则，对用人单位的陈述和提交的书证进行全面、客观、公正的审查。这包括审查证据的真实性、合法性以及关联性，即证据是否真实存在、是否合法取得、是否与案件事实有关联。
证明力比较：当用人单位的陈述与其提交的书证不一致时，法院会重点比较两者的证明力。一般来说，书证作为书面证据，其证明力往往强于口头陈述。但如果书证存在瑕疵或疑问，而用人单位的陈述能够与其他证据相互印证，形成完整的证据链，那么法院也可能采纳用人单位的陈述。
综合判断：法院不会仅凭用人单位的陈述或书证单一证据来认定案件事实，而是会结合全案证据进行综合判断。这包括考虑其他相关证据，如证人证言、鉴定意见、视听资料等，以及案件的具体情况和法律适用。
裁定结果：根据审查判断的结果，法院会作出相应的裁定。如果用人单位的陈述和书证均不足以证明其主张，法院可能会驳回其诉讼请求或抗辩理由；如果用人单位的陈述或书证能够证明其主张，法院则会支持其相应的诉讼请求或抗辩理由。
举例说明：假设在一起劳动争议案件中，用人单位主张劳动者严重违反公司规章制度，并提交了规章制度文本作为书证。但劳动者否认知晓该规章制度，且用人单位未能提供其他证据证明已将规章制度告知劳动者。在此情况下，法院可能会认为用人单位的书证（规章制度文本）虽然存在，但缺乏证明劳动者知晓的证据，因此不予采纳用人单位的主张。
建议：对于用人单位而言，在提交证据时应确保证据的真实性、合法性和关联性，并尽量提供完整的证据链以支持其主张。同时，在陈述事实时也应保持一致性和准确性，避免出现自相矛盾的情况。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。