结论前置：单位应缴纳的社保和公积金部分费用从劳动者工资里扣，这种做法是违法的，劳动者可以通过劳动仲裁来维护自身权益。以下为你详细分析：

1. 单位此做法的违法性
   • 根据《社会保险法》规定，用人单位应当自行申报、按时足额缴纳社会保险费，非因不可抗力等法定事由不得缓缴、减免。职工应当缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴，但这里明确是职工个人应缴纳的部分由单位代扣代缴，单位应缴纳的部分必须由单位自行承担，不能从劳动者工资中扣除。
   • 对于住房公积金，依据《住房公积金管理条例》，单位应当按时、足额缴存住房公积金，不得逾期缴存或者少缴，更不能将单位应缴部分转嫁给劳动者。单位为职工缴存的住房公积金的月缴存额为职工本人上一年度月平均工资乘以单位住房公积金缴存比例，这部分费用由单位承担，不能从劳动者工资里扣除。
2. 劳动仲裁的流程及注意事项
   • 申请与受理：劳动者需要准备劳动仲裁申请书，详细写明自己的基本信息、用人单位的基本信息、仲裁请求（如要求单位补缴社保和公积金、支付因单位违法行为给自己造成的损失等）、事实与理由等内容，同时要附上相关的证据材料，如劳动合同、工资条、社保和公积金缴纳记录等，以证明单位存在从工资中扣除其应缴纳的社保和公积金费用这一违法行为。将申请书和证据材料提交给有管辖权的劳动争议仲裁委员会，仲裁委员会在收到申请后，会在一定期限内审查并决定是否受理。
   • 开庭审理：如果仲裁委员会受理了申请，会安排开庭审理。在庭审过程中，劳动者和用人单位需要就争议事项进行陈述、举证、质证和辩论。劳动者要充分阐述自己的观点和诉求，提供有力的证据支持自己的主张。
   • 裁决：仲裁庭在审理结束后，会根据查明的事实和相关的法律法规作出裁决。如果裁决支持劳动者的诉求，单位需要按照裁决结果履行义务，如补缴社保和公积金、支付相应费用等。如果单位不履行裁决，劳动者可以向人民法院申请强制执行。
   • 注意事项：劳动者要注意劳动仲裁的时效问题，一般是从知道或者应当知道自己的权益受到侵害之日起一年内提出仲裁申请。同时，在整个仲裁过程中，要保留好相关的证据材料，积极配合仲裁委员会的工作。

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