结论：在员工提交离职申请后，公司未及时办理离职手续期间安排工作，员工拒绝完成，公司不能因此不支付工资。以下从多个角度进行分析：
一、法律义务与权利角度
公司的义务：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，公司有义务在员工离职时及时办理离职手续，包括结算工资、转移社保等。
- 在离职手续办理期间，若公司安排工作，应基于双方协商一致的原则，且该工作应与员工原岗位职责相关，且不影响离职手续的办理。
员工的权利：
- 员工有权在提交离职申请后，按照法律规定和公司规定的时间节点办理离职手续。
- 若公司未及时办理离职手续，且安排的工作与离职手续办理相冲突或不合理，员工有权拒绝完成，并要求公司按时办理离职手续及支付应得工资。
二、工资支付角度
工资支付原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的规定，公司应按照劳动合同约定的时间和标准支付员工工资。
- 工资支付是公司的法定义务，不因员工是否完成特定工作而免除，除非该工作是劳动合同中明确约定的且员工未履行。
特殊情况下的工资支付：
- 在员工提交离职申请后，若公司未及时办理离职手续，且在此期间安排了工作，但员工因合理原因（如离职手续办理、身体原因等）拒绝完成，公司仍应支付员工在此期间的工资。
- 若公司以员工未完成工作为由拒绝支付工资，可能构成违法克扣工资，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
三、实际操作建议
对于员工：
- 在提交离职申请后，应与公司明确离职手续办理的时间和流程，确保双方权益。
- 若公司安排的工作与离职手续办理相冲突或不合理，应及时与公司沟通并拒绝完成，同时保留相关证据（如邮件、聊天记录等）。
- 若公司拒绝支付工资，可向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自身合法权益。
对于公司：
- 在收到员工离职申请后，应及时办理离职手续，避免不必要的纠纷。
- 若需安排员工在离职前完成特定工作，应与员工协商一致，并确保该工作不影响离职手续的办理。
- 应按照法律规定和劳动合同约定支付员工工资，避免违法克扣工资的风险。
总结：在员工提交离职申请后，公司未及时办理离职手续期间安排工作，员工拒绝完成并不构成公司不支付工资的理由。公司应按照法律规定和劳动合同约定支付员工工资，并尽快办理离职手续。若双方因此产生纠纷，可通过协商、投诉或劳动仲裁等方式解决。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。