合同变更将工资调整为基本工资是否合法，需根据具体情况判断，但核心原则是必须合法合规且协商一致。以下从不同角度为您详细分析：
一、合法性基础与条件
劳动合同约定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第十七条，劳动合同应明确劳动报酬条款。若原合同中已约定工资构成（如包含基本工资、绩效工资等），且调整后的基本工资不低于当地最低工资标准，同时双方协商一致，则调整是合法的。
- 实例说明：若原合同约定工资为“基本工资3000元+绩效工资2000元”，现双方协商一致将工资调整为“基本工资4000元（含原绩效工资中的部分）+绩效工资1000元”，且调整后的基本工资不低于当地最低工资标准，则此调整合法。
协商一致原则：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括工资。变更劳动合同应当采用书面形式。
- 关键点：未经劳动者同意，用人单位单方面变更工资结构（如将绩效工资全部或部分调整为基本工资）可能构成违约，除非符合其他法定情形。
不违反最低工资标准：
- 调整后的工资总额（包括基本工资和绩效工资等）不得低于当地最低工资标准。这是法律对劳动者基本生活保障的底线要求。
二、合法变更工资的流程与注意事项
提出方案：
- 用人单位应根据经营状况、薪酬策略等拟定调薪方案，明确调整依据（如岗位评估、市场数据、绩效考核结果等）。
沟通协商：
- 与员工就调薪原因、幅度进行充分沟通，解答疑问并听取意见。这是确保协商一致的关键步骤。
签订变更协议：
- 双方签署《劳动合同变更书》，注明新的工资构成及生效日期。例如：“自XXXX年XX月XX日起，乙方工资调整为基本工资XXXX元/月（含原绩效工资中的XXXX元），绩效工资XXXX元/月。”
三、不合法变更工资的情形与风险
用人单位单方无故降低工资：
- 若用人单位未经与劳动者协商，无故降低工资（包括将绩效工资全部或部分调整为基本工资但降低总额），则违反合同约定，侵害员工权益。
- 法律后果：劳动者有权要求用人单位按照原劳动合同约定的工资标准支付工资，并可向劳动争议仲裁机构申请仲裁，要求用人单位赔偿因违法变更工资造成的损失。
以欺诈、胁迫等手段变更工资：
- 若用人单位以欺诈、胁迫手段使劳动者在违背真实意思的情况下接受工资变更，则变更无效且违法。
- 法律后果：劳动者有权解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿。
四、建议措施
加强沟通与协商：
- 在进行工资结构调整前，用人单位应充分听取员工的意见和建议，与员工进行充分的沟通和协商，确保调整方案得到员工的理解和支持。
确保考核公正透明：
- 若工资调整与绩效考核结果挂钩，则应建立科学、公正的绩效考核体系，确保考核结果的客观性和准确性。同时，应确保考核制度经过民主程序制定并公示或告知员工。
遵守法律法规：
- 严格遵守《劳动合同法》、《劳动法》等相关法律法规的规定，确保工资结构调整的合法性和合规性。特别是要确保调整后的工资总额不低于当地最低工资标准。
总结来说，合同变更将工资调整为基本工资是否合法，关键在于是否合法合规且协商一致。若用人单位能确保调整方案合法、公正、透明，并与员工充分沟通协商达成一致意见，则调整是合法的。否则，可能面临法律风险和劳动争议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。