结论：工人进场工作两个月后辞工，用人单位扣补底薪的行为是否合法，需根据具体情况判断。若用人单位扣补底薪的行为缺乏合法依据，则属于违法行为，工人有权要求用人单位支付全额工资；若双方有明确约定且该约定不违反法律法规，则可能合法，但需谨慎审查约定内容。

分析说明：

1. 从法律法规角度：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。劳动报酬应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。
   • 若用人单位在工人辞工时扣补底薪，且没有合法依据（如双方未约定、约定违反法律法规等），则该行为属于违法行为，工人有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求用人单位支付全额工资。

2. 从双方约定角度：

   • 如果用人单位与工人在劳动合同或入职协议中明确约定了辞工时需扣补底薪的条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么该约定可能具有法律效力。但即便如此，用人单位也需确保该约定公平合理，不损害工人的合法权益。
   • 需特别注意：即使双方有约定，如果该约定显失公平（如扣补金额过高、扣补条件过于苛刻等），工人仍有可能通过法律途径主张该约定无效或部分无效。

3. 从实际操作角度：

   • 工人在入职时应仔细阅读劳动合同或入职协议，了解其中关于工资支付、辞工扣补等条款的内容。如有疑问，应及时向用人单位提出并寻求解答。
   • 若工人发现用人单位存在扣补底薪等违法行为，应保留好相关证据（如工资条、劳动合同、入职协议等），并及时向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。

建议行动：

• 工人方面：若遇到用人单位扣补底薪的情况，首先应与用人单位协商解决；协商无果的，可以向当地劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 用人单位方面：应严格遵守法律法规，确保工资支付等劳动报酬事项的合法性和合理性；同时，在与工人签订劳动合同时，应明确约定相关条款，避免产生不必要的纠纷。

后续思考依据：

• 在处理类似纠纷时，劳动监察部门或劳动仲裁机构会依据相关法律法规和双方约定进行裁决。因此，了解并遵守法律法规、明确约定条款是预防和处理此类纠纷的关键。
• 工人在维护自己合法权益的同时，也应注重保留好相关证据，以便在需要时提供有力支持。