科长在试用期被立案，是否能转正需根据具体情况判断，无法直接给出肯定或否定的结论。以下从不同角度进行分析：
一、立案性质与影响
立案性质：
- 如果立案涉及的是科长个人的违法行为，且该行为严重违反了单位规章制度或法律法规，那么这很可能成为其转正的障碍。单位在考虑是否转正时，会综合评估员工的品行、能力、工作表现以及是否符合岗位要求等因素。
- 如果立案与科长的工作职责无直接关联，或者立案后经调查证明科长无罪或责任较轻，那么这可能不会对其转正产生太大影响。
影响程度：
- 立案本身并不直接决定科长是否能转正，但立案所揭示的问题性质、严重程度以及处理结果，将直接影响单位的决策。例如，如果立案导致科长被刑事拘留或逮捕，那么其显然无法继续履行工作职责，转正也就无从谈起。
- 即使立案后科长未被采取强制措施，但如果立案事项严重损害了单位声誉或利益，或者引起了社会广泛关注，单位也可能出于形象考虑而决定不转正。
二、单位规章制度与劳动合同
单位规章制度：
- 单位通常会在规章制度中明确规定员工在试用期内应遵守的行为规范以及转正的条件。如果科长在试用期内被立案，且该行为违反了单位规章制度中的相关规定，那么单位有权根据规章制度决定不转正。
劳动合同：
- 劳动合同是双方约定权利义务的书面文件。如果劳动合同中明确规定了试用期内的转正条件，且科长因被立案而无法满足这些条件，那么单位也有权根据劳动合同决定不转正。
三、法律建议与后续行动
法律建议：
- 如果科长认为立案事项与其工作无关，或者认为单位的决定不公正，可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的救济途径。
- 在处理此类问题时，科长应保持冷静，积极配合调查，并尽可能提供有利于自己的证据和材料。
后续行动：
- 科长可以主动与单位沟通，说明立案事项的具体情况，表达自己对工作的态度和决心，争取单位的理解和支持。
- 如果单位决定不转正，科长可以要求单位出具书面说明，并了解不转正的具体原因。如果认为单位的决定存在违法或不合理之处，可以考虑通过法律途径维护自己的权益。
总结来说，科长在试用期被立案是否能转正，取决于立案的性质、影响程度、单位规章制度以及劳动合同中的相关规定。在处理此类问题时，建议科长保持冷静、积极沟通，并咨询专业律师以了解自己的法律权益和可能的救济途径。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。