结论：迟到被扣二十块是否违法，需结合具体情况判断，若公司规章制度合法且扣款合理，则不违法；若规章制度违法或扣款不合理，则可能违法。以下从不同角度详细分析：
一、公司规章制度合法性角度
规章制度需合法制定：
- 根据《劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
- 若公司规章制度未经上述程序制定，或内容违反法律、行政法规及政策规定，则该规章制度不合法，以此为依据的扣款行为可能违法。
规章制度需公示或告知劳动者：
- 规章制度制定后，用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
- 若公司未公示或告知劳动者规章制度内容，劳动者有权主张该规章制度对其不产生约束力，以此为依据的扣款行为可能违法。
二、扣款合理性角度
扣款金额需合理：
- 即使公司规章制度合法，扣款金额也需合理。迟到扣款一般不应超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
- 若公司规章制度中规定的扣款金额过高，或扣除后劳动者工资低于最低工资标准，则该扣款行为可能违法。
扣款需与劳动者过错相适应：
- 扣款应与劳动者的过错程度相适应，不能过度惩罚。例如，劳动者偶尔迟到一次，且未对公司造成重大损失，公司扣款二十元可能较为合理；但若劳动者频繁迟到，或迟到导致公司重大损失，公司扣款二十元可能显得过轻或过重（需结合具体情况判断）。
三、实际操作建议
劳动者角度：
- 若认为公司扣款行为违法，可先与公司协商解决；协商不成，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 保留相关证据，如工资条、考勤记录、公司规章制度等，以便维权时使用。
公司角度：
- 制定合法、合理的规章制度，并确保公示或告知劳动者。
- 扣款时遵循合理性原则，避免过度惩罚劳动者。
- 若与劳动者发生纠纷，积极协商解决，避免矛盾升级。
举例说明：假设某公司规章制度规定“迟到一次扣款二十元”，且该规章制度已依法制定并公示。若劳动者偶尔迟到一次，公司扣款二十元，且扣除后劳动者工资不低于最低工资标准，则该扣款行为合法；但若劳动者频繁迟到，或公司规章制度未经合法程序制定，或扣款后劳动者工资低于最低工资标准，则该扣款行为可能违法。
如有更多疑问或需要进一步法律帮助，请直接向我咨询。