结论：您现在在职期间可以申请仲裁确认劳动关系，且申请仲裁确认劳动关系一般不受一年仲裁时效的限制，但若涉及后续赔偿等请求则可能受时效约束。以下是具体分析：
一、关于在职期间申请仲裁确认劳动关系
法律依据：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条的规定，因确认劳动关系发生的争议，属于劳动争议仲裁委员会的受理范围。因此，您在职期间完全有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以确认您与用人单位之间是否存在劳动关系。
实际操作：在实际操作中，即使您已经在职多年且未签订书面劳动合同，只要您能提供足够证据证明您与用人单位之间存在事实劳动关系（如工资支付记录、工作证、考勤记录、同事证言等），仲裁委员会通常会受理您的仲裁申请，并依法作出裁决。
二、关于申请仲裁的时间限制
确认劳动关系的时效：对于确认劳动关系的仲裁请求，法律并未明确规定具体的仲裁时效。这是因为确认劳动关系是后续处理其他劳动争议（如工资、社保、经济补偿等）的前提和基础，其本身并不直接涉及具体的权益损害赔偿。因此，您在职期间可以随时申请仲裁确认劳动关系，不受一年仲裁时效的限制。
后续赔偿请求的时效：然而，如果您在确认劳动关系后，还希望就未签订书面劳动合同、未支付加班费、未缴纳社保等违法行为提出赔偿请求，那么这些请求将受到一年仲裁时效的限制。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。但需要注意的是，对于劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生的争议，劳动者申请仲裁不受一年仲裁时效期间的限制；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
三、建议与注意事项
及时收集证据：为了支持您的仲裁申请，建议您尽快收集并整理好能够证明您与用人单位之间存在事实劳动关系的证据材料。
咨询专业律师：虽然我在这里为您提供了一些基本的法律指导，但劳动争议案件往往涉及复杂的法律问题和证据规则。因此，在正式提交仲裁申请前，我建议您咨询一位专业律师，以便更全面地了解您的权利和义务，并制定出更有效的仲裁策略。
关注时效问题：如果您在确认劳动关系后还希望提出其他赔偿请求，请务必关注一年仲裁时效的限制，并在时效期内及时提出仲裁申请。
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