结论：事业单位员工因档案年龄与实际退休年龄不一致，导致晚退休一年，一般情况下不需要退还已领取的工资，但具体还需根据单位规定和实际情况来判断。以下从不同角度进行分析：
一、法律层面分析
退休年龄的认定：
- 退休年龄的认定通常依据档案年龄或身份证年龄，但具体以哪个为准，可能因地区和单位政策而异。若单位依据档案年龄确定退休时间，而员工实际晚退休一年，这通常属于单位内部管理问题，而非员工个人责任。
工资支付的法律义务：
- 根据《劳动法》及相关规定，员工在提供正常劳动的情况下，单位有义务按时足额支付工资。因此，在员工晚退休的这一年里，如果其确实提供了劳动，单位支付工资是合法的，员工无需退还。
二、单位规定与实际情况
单位内部规定：
- 不同的事业单位可能有不同的内部规定，关于退休年龄的认定、工资支付等。如果单位有明确规定，在档案年龄与实际退休年龄不一致的情况下如何处理工资问题，那么应遵循单位规定。
- 若单位规定因档案年龄问题导致晚退休的，工资不予退还或另有补偿机制，则按单位规定执行。
实际情况考量：
- 实际情况中，还需考虑员工晚退休的原因、是否提供了正常劳动、单位是否因此遭受了损失等因素。如果员工晚退休并非因其个人原因，且提供了正常劳动，单位通常无权要求退还工资。
三、可能存在的争议与解决方式
争议点：
- 如果单位认为因档案年龄问题导致晚退休，给单位带来了额外负担或损失，可能会要求员工退还部分工资或承担其他责任。
解决方式：
- 双方应首先通过协商解决争议。如果协商不成，可以依据单位内部规定或相关法律法规，通过劳动仲裁或诉讼等途径解决。
- 在此过程中，员工应保留好相关证据，如工作记录、工资单等，以证明自己提供了正常劳动，并有权获得相应工资。
建议：针对您的情况，我建议您首先查阅单位的相关规定，了解关于退休年龄认定和工资支付的具体条款。如果单位有明确规定，且您符合规定条件，则无需退还工资。如果单位规定不明确或存在争议，建议您与单位进行协商，或寻求法律援助以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。