劳动者在申请劳动仲裁时，如遇到材料不全且公司不配合的情况，应积极采取措施确保仲裁程序的正当进行，并维护自己的合法权益。 以下是从多个角度为你提供的详细建议：
仲裁前及立案阶段
补充完善证据材料：
- 尽管当前材料不全，但劳动者应尽力收集与劳动争议相关的所有证据，如工资支付记录、考勤记录、工作成果文件、劳动合同、社保缴纳记录等。这些证据将有力支持你的诉求，并增加仲裁成功的可能性。
- 若某些证据确实无法自行获取，可尝试通过合法途径（如向公司书面申请提供）或请求仲裁委员会协助调取。
积极与公司沟通并书面催告：
- 尝试与公司进行友好沟通，明确告知其你正在申请劳动仲裁，并请求其配合提供相关证据或参与仲裁程序。
- 若公司拒绝配合，可通过书面函件（如律师函）催告其履行义务，并明确指出不配合的法律后果，如可能面临的法律责任、声誉损失等。
借助劳动监察部门力量：
- 若公司拒绝签收仲裁文书或故意拖延时间，影响仲裁程序的正常进行，你可向当地劳动监察部门投诉。
- 劳动监察部门有权对公司进行监督检查，并责令其改正违法行为，包括配合劳动仲裁程序。
申请财产保全（如适用）：
- 若你担心公司在仲裁期间转移财产，导致裁决后无法执行，可向仲裁委员会申请财产保全。
- 仲裁委员会将把你的申请转交至人民法院，由人民法院决定是否采取保全措施。
仲裁审理阶段
公司不出庭情况：
- 根据《劳动人事争议仲裁办案规则》及《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，若公司无正当理由拒不到庭或中途退庭，仲裁庭有权进行缺席裁决。
- 这意味着，即使公司不配合，仲裁庭仍可根据你提供的证据和陈述作出裁决。
公司不提供证据情况：
- 若争议事项相关的证据属于公司掌握管理，而公司拒绝提供，仲裁庭可能倾向于采信你的主张。
- 仲裁庭还有权责令公司提交相关证据，若公司拒不提交，可能面临不利的法律后果。
裁决执行阶段
查看裁决书规定期限：
- 裁决书送达之日起十五日内，若公司未提起诉讼，则裁决生效。
- 你应密切关注裁决书的送达情况，并确保在规定期限内采取后续行动。
提交强制执行申请：
- 若裁决已生效，而公司仍不履行义务，你可向人民法院申请强制执行。
- 提交执行申请书时，需附上裁决书、公司财产线索等相关材料，以便法院顺利执行。
配合法院工作：
- 在申请执行过程中，你应积极配合法院的工作，提供公司的财产线索、经营状况等信息。
- 这有助于法院更快地找到并执行公司的财产，从而保障你的合法权益。
其他重要措施
保留相关证据：
- 在整个劳动仲裁过程中，你应妥善保留所有与争议相关的证据，包括书面材料、电子数据、证人证言等。
- 这些证据将在仲裁和执行阶段发挥关键作用，确保你的权益得到充分保障。
向公司直接沟通（如适用）：
- 若公司有相关负责人或联系人，你可尝试与其直接沟通，明确告知其不配合的后果及应尽的义务。
- 有时，直接的沟通可能更有效地解决问题，避免不必要的法律纠纷。
向劳动行政部门举报（如公司存在恶意行为）：
- 若公司存在恶意不配合行为，如隐匿、销毁证据等，你可向劳动行政部门举报。
- 劳动行政部门将对公司进行查处，并可能对其处以罚款、吊销营业执照等处罚。
在整个过程中，若你遇到任何困难或疑问，可直接向我咨询。 作为专业律师，我将根据你的具体情况提供有针对性的法律建议，并协助你顺利完成劳动仲裁程序。