结论：员工旷工离职时，单位在符合法定条件和程序的情况下，会开具解除劳动合同协议（或证明）。但具体是否开具以及开具的时间和内容，需根据单位规章制度、劳动合同约定及旷工具体情况来判断。
详细分析：
单位规章制度与劳动合同约定：
- 单位通常会在其规章制度中明确旷工行为及后果，包括旷工达到何种程度（如连续旷工3天或累计旷工5天等）将被视为严重违反规章制度，从而赋予单位解除劳动合同的权利。
- 劳动合同中也可能对旷工行为及解除劳动合同的条件进行约定。若单位规章制度或劳动合同中明确规定了旷工离职时单位需开具解除劳动合同协议（或证明），则单位应履行此义务。
旷工行为的严重性：
- 法律并未对“严重违反用人单位规章制度”的旷工行为设定统一标准。因此，单位需在合法的规章制度中明确规定何种程度的旷工属于“严重”。
- 若员工旷工行为达到单位规章制度中规定的严重程度，单位有权解除劳动合同，并应按照法定程序开具解除劳动合同协议（或证明）。
解除程序的合法性：
- 当员工旷工达到规章制度规定的严重程度时，单位不能直接解除劳动合同，而需遵循法定程序。首先，应将解除劳动合同的理由通知工会（如已建立工会），并听取工会的意见。
- 单位还需向员工出具解除劳动合同的书面通知（即解除劳动合同协议或证明），明确说明解除的理由和依据。此过程应确保公正、合法，不违反劳动法律法规的规定。
单位拒绝开具证明的法律责任：
- 如果单位违反法律规定，拒绝为员工开具解除劳动合同证明，员工有权采取以下措施维护自身权益：
- 沟通协商：首先尝试与单位进行沟通协商，明确说明其应履行的法律责任。
- 投诉举报：若协商不成，员工可以向当地的劳动监察部门进行投诉举报，要求单位为其开具证明。劳动行政部门将依法责令单位改正，并视情节轻重给予相应的行政处罚。
- 法律途径维权：如果单位的行为给员工造成了损害，员工还可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径追究单位的赔偿责任。
建议：
- 对于单位而言，应建立健全的规章制度，明确旷工行为及后果，并在行使解除权时严格遵循法定程序，确保为员工开具解除劳动合同协议（或证明）。
- 对于员工而言，应了解并遵守单位的规章制度，避免旷工行为的发生。如因旷工面临解除劳动合同的风险时，应及时咨询专业法律人士（如我）的意见，以维护自己的合法权益。
法律依据：
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条：劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第五十条：用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。
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