结论：用营业执照上电动自行车牌后卖给别人但不过户，仅写协议的方式是不可行的，这种做法存在诸多法律风险和问题，不建议采取。
法律背景与风险分析：
过户的必要性：
- 根据相关法律法规，车辆（包括电动自行车）的买卖应当办理过户手续，以确保车辆所有权的合法转移。过户是车辆所有权变更的法定程序，未办理过户手续，车辆的所有权并未真正转移给买方。
- 如果仅签订协议而不过户，从法律上讲，车辆的所有权仍然属于原车主（即营业执照上的持有人）。这意味着，如果车辆发生交通事故、被盗抢或涉及其他法律纠纷，原车主可能需要承担相应的法律责任。
协议的法律效力：
- 虽然双方可以签订协议来约定车辆买卖的相关事宜，但这种协议并不能替代过户手续。协议在双方之间可能具有一定的约束力，但在对外关系上，如涉及第三方（如交通事故中的受害者、保险公司等），协议可能无法产生预期的法律效果。
- 如果买方在使用车辆过程中违反交通法规或造成他人损害，由于车辆未过户，原车主可能因车辆登记在其名下而被追究责任。
实际操作中的问题：
- 在实际操作中，如果车辆未过户，买方在办理车辆年检、保险、维修等手续时可能会遇到困难。因为这些手续通常需要提供车辆所有权证明，而未过户的车辆无法提供有效的所有权证明。
- 此外，如果原车主因债务纠纷或其他原因被法院查封、扣押财产，未过户的车辆也可能被纳入查封、扣押范围，从而给买方带来不必要的损失。
法律建议：
- 办理过户手续：为了确保车辆所有权的合法转移和避免潜在的法律风险，建议在买卖电动自行车时办理过户手续。这不仅可以保护双方的合法权益，还可以避免后续可能出现的纠纷和麻烦。
- 完善协议内容：如果双方确实希望仅通过协议来约定车辆买卖事宜（尽管不推荐），那么协议内容应当尽可能完善、明确。例如，可以约定车辆交付时间、地点、方式、价款支付方式、违约责任等条款，并明确双方的权利和义务。但即便如此，也无法完全替代过户手续的法律效力。
- 咨询专业律师：在涉及车辆买卖等法律事务时，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和帮助，确保双方的权益得到充分保护。
可能后果：
- 如果未办理过户手续而仅签订协议，一旦车辆发生交通事故或涉及其他法律纠纷，原车主可能需要承担不必要的法律责任和经济损失。
- 买方在使用车辆过程中也可能因无法提供有效的所有权证明而遇到各种困难和麻烦。
因此，为了保障双方的合法权益和避免潜在的法律风险，建议务必办理电动自行车的过户手续。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。