结论：员工因第三人受伤没有认定工伤的情况下，一般不能直接向公司主张侵权纠纷，但具体还需根据实际情况和法律规定来判断。以下从不同角度进行分析：
一、工伤认定与侵权纠纷的基本关系
工伤认定：根据《工伤保险条例》的相关规定，工伤认定主要关注的是职工在工作时间、工作场所内，因工作原因受到的伤害。如果员工因第三人受伤，但该伤害未被认定为工伤，那么从工伤保险的角度，员工无法享受工伤保险待遇。
侵权纠纷：侵权纠纷则是指因第三人的过错行为导致他人受到损害，受害者有权要求侵权人承担民事赔偿责任。在员工因第三人受伤的情况下，如果第三人存在过错，员工当然有权向第三人主张侵权损害赔偿。
二、未认定工伤时向公司主张侵权纠纷的可能性
一般原则：在未认定工伤的情况下，员工通常不能直接向公司主张侵权纠纷。因为公司并非直接侵权人，且工伤认定是享受工伤保险待遇和向公司主张相关权益的前提。
特殊情况：然而，也存在一些特殊情况。例如，如果公司存在过错行为（如未提供安全的工作环境、未履行安全保障义务等），且该过错行为与员工受伤之间存在因果关系，那么员工可能有权向公司主张侵权纠纷。但这种情况需要具体分析，且员工需要承担相应的举证责任。
三、实际操作建议
及时报警并寻求医疗救助：员工在遭受第三人侵权伤害后，应立即报警并寻求医疗救助，以确保自己的生命安全和身体健康。
申请工伤认定：尽管员工可能因各种原因未被认定为工伤，但申请工伤认定是享受工伤保险待遇和进一步维权的重要步骤。员工应尽快向所在单位报告事故情况，并按照单位要求提交工伤认定申请。
收集证据材料：在申请工伤认定和主张侵权纠纷的过程中，员工需要收集充分的证据材料来支持自己的请求。这些证据材料可能包括医疗证明、事故现场照片、证人证言、报警记录等。
咨询专业律师：由于法律问题的复杂性和专业性，员工在处理此类纠纷时最好咨询专业律师的意见。律师可以根据员工的实际情况和法律规定，为员工提供具体的法律建议和维权方案。
最后，员工因第三人受伤没有认定工伤的情况下，一般不能直接向公司主张侵权纠纷。但员工仍应积极采取措施保护自己的合法权益，如申请工伤认定、收集证据材料等。如果公司存在过错行为且该过错行为与员工受伤之间存在因果关系，员工可能有权向公司主张侵权纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。