结论：停工留薪期过了三年以后，是否还能申请仲裁，这主要取决于具体的仲裁请求以及是否超过了法律规定的仲裁时效。以下分情况详细说明：

1. 若仲裁请求与停工留薪期内的待遇相关，且未超过仲裁时效：

   • 法律背景：根据《劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。但是，如果劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受该一年仲裁时效期间的限制；不过，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
   • 分析：如果您的仲裁请求是关于停工留薪期内的工资、福利等劳动报酬，且您与用人单位的劳动关系仍然存续，那么您申请仲裁可能不受一年时效的限制。但如果劳动关系已经终止，且自终止之日起已经超过一年，那么您可能就这部分请求失去了申请仲裁的权利。
   • 建议：如果您的劳动关系仍然存续，且您认为用人单位在停工留薪期内未支付您应得的劳动报酬，建议您尽快向劳动仲裁机构申请仲裁，以维护自己的合法权益。

2. 若仲裁请求与停工留薪期外的其他劳动争议相关：

   • 法律背景：同样依据《劳动争议调解仲裁法》第二十七条，对于其他类型的劳动争议，如因确认劳动关系发生的争议、因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议等，申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
   • 分析：如果您的仲裁请求是关于停工留薪期外的其他劳动争议，且自您知道或应当知道权利被侵害之日起已经超过一年，那么您可能就失去了申请仲裁的权利。
   • 建议：对于这类争议，如果您认为自己的权益受到了侵害，且未超过仲裁时效，建议您及时收集证据，向劳动仲裁机构申请仲裁。

3. 特殊情况：存在时效中断或中止的情形：

   • 法律背景：根据《劳动争议调解仲裁法》第二十七条第二款和第三款，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在本条第一款规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。
   • 分析：如果您在仲裁时效期间内，因为向用人单位主张权利、向有关部门请求权利救济或者用人单位同意履行义务等原因导致时效中断，或者因为不可抗力或其他正当理由导致时效中止，那么您的仲裁时效可能会重新计算或继续计算。
   • 建议：如果您认为存在时效中断或中止的情形，建议您收集相关证据，并在仲裁时效期间内及时向劳动仲裁机构申请仲裁。

总结与进一步行动建议：

• 停工留薪期过了三年以后是否还能申请仲裁，取决于您的具体仲裁请求以及是否超过了法律规定的仲裁时效。
• 如果您认为自己的权益受到了侵害，且未超过仲裁时效，建议您及时收集证据，向劳动仲裁机构申请仲裁。
• 如果您对仲裁时效、仲裁程序或相关法律法规有疑问，或者需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。