针对您提出的“停工留薪期超过一年怎么申请仲裁”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，停工留薪期的确定是申请仲裁的前提。停工留薪期一般基于医疗机构出具的病假单或诊断证明来确定，其期限通常不超过12个月。在特殊情况下，如果经过劳动能力鉴定委员会的确认，停工留薪期可以适当延长，但延长的期限同样不得超过12个月。因此，如果您的停工留薪期已经超过了一年，这通常意味着已经经过了可能的延长，且需要确保这一延长是经过劳动能力鉴定委员会确认的。

接下来，关于申请劳动仲裁的时效，您需要知道，自您知道或应当知道您的权利被侵害之日起一年内，您需要向劳动争议调解仲裁委员会提起仲裁申请。这是申请仲裁的法定时效期间，如果超过了这个期限，您可能会丧失仲裁申请权。不过，如果因不可抗力或其他正当理由导致时效中止，待原因消除后，时效是可以继续计算的。

在准备仲裁申请材料时，您需要包括：

1. 仲裁申请书：详细写明申请人、被申请人信息，仲裁请求及事实和理由。
2. 身份证明：如身份证复印件等。
3. 劳动合同：证明您与用人单位之间的劳动关系。
4. 工伤认定决定书（如适用）：如果您的停工留薪期是由于工伤导致的，需要提供此证明。
5. 关键证据：
   • 劳动关系证明：如工资支付记录、工作证、考勤记录等，以证明您与用人单位之间的劳动关系持续存在。
   • 停工留薪期证明：医疗机构出具的诊断证明、病历、病假单等，以证明您的停工留薪期确实超过了常规期限，并且这一延长是经过合法确认的。
   • 工资标准证明：劳动合同中的工资条款、工资条、工资制度文件等，以证明您在停工留薪期间的应得工资。

准备好材料后，您需要向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提交申请材料，并等待初步审查。审查通过后，仲裁委员会会组成仲裁庭，并在开庭五日前书面通知双方当事人。

在开庭审理流程中，您需要陈述仲裁请求及事实理由，被申请人会进行答辩。接着，双方会出示并相互质证证据。之后，仲裁庭会围绕争议焦点进行辩论，并尝试调解。如果调解成功，会制作调解书；如果调解不成，仲裁庭会根据审理查明的事实和法律法规作出裁决。

最后，关于仲裁裁决与执行，仲裁庭一般会在受理之日起四十五日内结束裁决，复杂案件可延期十五日。裁决结果出来后，如果用人单位不履行裁决，您可以向人民法院申请强制执行。

在整个过程中，证据的重要性不言而喻。您需要确保所提供的证据完整、真实、关联，以支持您的仲裁请求。同时，也要注意仲裁时效的中止与恢复情况，确保您的申请在法定时效期间内提出。

希望以上解答能够帮助您更好地理解停工留薪期超过一年后如何申请仲裁的流程。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。