结论：公司单方面提出停薪留职，若未经劳动者同意，劳动者有权申请劳动仲裁，以维护自身合法权益。
分析说明：
停薪留职的合法性：
- 停薪留职并非法律上的常规制度，其合法性及具体实施需依据双方签订的劳动合同、公司规章制度或相关法律法规的特别规定。
- 若劳动合同或公司规章制度中明确规定了停薪留职的条件、程序及待遇等，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司提出停薪留职可能具有合法性。但即便如此，公司也需与劳动者协商一致，不能单方面决定。
公司单方面提出停薪留职的法律后果：
- 若公司未经劳动者同意，单方面提出停薪留职，这可能构成对劳动合同的变更或解除，违反了《劳动合同法》中关于劳动合同变更和解除的规定。
- 劳动者有权拒绝公司的单方面决定，并要求公司继续履行原劳动合同，支付工资及福利待遇。若公司坚持停薪留职，劳动者可以申请劳动仲裁，要求公司支付拖欠的工资、经济补偿金等。
劳动仲裁的申请与流程：
- 劳动者在申请劳动仲裁时，需准备相关证据材料，如劳动合同、工资单、公司停薪留职的通知等，以证明公司的违法行为。
- 劳动仲裁的流程一般包括提交仲裁申请、仲裁庭受理、开庭审理、裁决等步骤。劳动者需按照仲裁庭的要求参与仲裁活动，并遵守仲裁庭的裁决。
法律建议：
- 若公司提出停薪留职，劳动者应首先与公司进行协商，了解公司的具体意图和条件，并尝试达成一致意见。
- 若协商无果，劳动者可以拒绝公司的单方面决定，并要求公司继续履行原劳动合同。若公司坚持停薪留职，劳动者应及时收集相关证据材料，准备申请劳动仲裁。
- 在申请劳动仲裁前，劳动者也可以咨询专业律师的意见，以更好地了解自己的权益和维权途径。
可能面临的法律后果：
- 若劳动仲裁裁决支持劳动者的诉求，公司需支付拖欠的工资、经济补偿金等，并可能面临其他法律责任。
- 若劳动者未能在规定时间内申请劳动仲裁或未能提供充分证据支持自己的诉求，可能面临败诉的风险。
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