休息日加班仅支付一倍工资，在大多数情况下是不合法的。具体分析如下：
一、标准工时制下的休息日加班
在标准工时制下，员工每周工作不超过40小时，超出部分视为加班。根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。这意味着，如果用人单位在休息日（如周六、周日）安排员工加班，且无法安排补休的情况下，必须按照员工正常工资的200%支付加班费。因此，仅支付一倍工资是不符合法律规定的。
二、综合计算工时工作制下的休息日加班
综合计算工时工作制是针对因工作性质特殊，需连续作业或受季节及自然条件限制的企业的部分职工，采用的以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的一种工时制度。在综合计算周期内，如果员工的总实际工作时间超过总法定标准工作时间，则超出部分视为延长工作时间，应按照不低于劳动合同规定的员工本人小时工资标准的150%支付工资报酬。但对于休息日加班是否应支付双倍工资，需看综合计算周期内的总工作时间是否已超出法定标准。若未超出，则休息日加班可能不视为加班，无需支付额外加班费；若超出，则超出部分的休息日加班也应按相应标准支付加班费，不过不一定是严格意义上的“双倍”，而是根据综合计算后的结果确定。然而，实践中常简化为：若综合计算周期内已保障员工休息权益且总工时未超标，休息日工作可不另付加班费；若超标，则至少应按延长工时的150%支付，特定情形下（如无法调休且企业规定更优惠）可能按双倍处理。但无论如何，仅支付一倍工资在大多数情况下是不符合法律规定的。
三、不定时工作制下的休息日加班
不定时工作制是指因生产特点、工作特殊需要或职责范围的关系，无法按标准工作时间衡量或需要机动作业的职工所采用的工时制度。经批准实行不定时工作制的职工，不受《劳动法》第四十一条规定的日延长工作时间标准和月延长工作时间标准的限制，但用人单位应采用弹性工作时间等适当的工作和休息方式，确保职工的休息休假权利和生产、工作任务的完成。一般情况下，不定时工作制下的员工在休息日工作不视为加班，无需支付加班费。但如果用人单位在休息日安排员工从事与本职工作无关的任务，或虽与本职工作有关但未安排补休的，仍需支付加班费，具体标准由双方协商或依据企业规章制度确定。但即便如此，也通常不会仅支付一倍工资作为加班费。
四、注意事项与维权途径
综上所述，休息日加班仅支付一倍工资在大多数情况下是不合法的。如果您遇到了类似的问题，或者有任何其他劳动纠纷方面的疑问，都可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议。