结论：医学毕业生在未取得医师证前，在医疗机构可能存在事实劳动关系，但需根据具体情况判断。
分析说明：
事实劳动关系的认定：
- 事实劳动关系是指用人单位与劳动者之间，虽未签订书面劳动合同，但双方实际履行了劳动权利和义务而形成的劳动关系。
- 认定事实劳动关系，通常需要考虑劳动者是否实际提供了劳动、是否接受了用人单位的管理、是否获得了相应的劳动报酬等因素。
医学毕业生未取得医师证的情况：
- 医学毕业生在未取得医师证前，其身份可能仍为学生或实习人员，但这并不妨碍其与医疗机构之间形成事实劳动关系。
- 如果医学毕业生在医疗机构中实际从事了医疗相关工作，接受了医疗机构的管理，并获得了相应的劳动报酬，那么其与医疗机构之间就可能存在事实劳动关系。
相关法律法规：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系。这一规定并未要求劳动者必须具备某种特定资质或证书。
- 因此，即使医学毕业生未取得医师证，只要其实际提供了劳动并符合事实劳动关系的认定条件，就可以认定其与医疗机构之间存在劳动关系。
特殊情况考虑：
- 如果医学毕业生在医疗机构中的活动仅限于学习、实习或培训，并未实际从事医疗相关工作，也未接受医疗机构的管理和获得劳动报酬，那么其与医疗机构之间就不构成事实劳动关系。
- 此外，如果医疗机构与医学毕业生之间明确约定了实习或培训关系，并排除了劳动关系的可能性，那么也应尊重双方的约定。
法律建议：
- 对于医学毕业生而言，在未取得医师证前在医疗机构工作，应明确自己的身份和权益，了解是否与医疗机构形成了事实劳动关系。
- 如果形成了事实劳动关系，医学毕业生应享有与正式员工相同的劳动权益，如获得劳动报酬、享受社会保险等。
- 如果医疗机构未与医学毕业生签订书面劳动合同或未明确双方关系，医学毕业生可以通过与医疗机构协商、向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁等方式来维护自己的权益。
可能后果：
- 如果医学毕业生与医疗机构之间存在事实劳动关系而未得到确认，医学毕业生可能无法享受应有的劳动权益，如劳动报酬、社会保险等。
- 在发生劳动争议时，如果无法证明事实劳动关系的存在，医学毕业生可能面临维权困难的情况。
如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。