结论前置：公安机关在调查员工偷盗行为的过程中，不可以直接停付该员工的五险一金。五险一金的缴纳与公安机关的调查行为无直接关联，其缴纳义务主要由用人单位承担，并受相关法律法规的严格规范。

详细分析：

1. 五险一金的缴纳义务：

   • 根据《中华人民共和国社会保险法》及相关规定，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记，并按时足额缴纳社会保险费（包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险，即“五险”）。同时，住房公积金的缴纳也受《住房公积金管理条例》的规范，用人单位同样需要按时足额缴纳。
   • 这些缴纳义务是法定的，不因员工是否涉嫌违法犯罪而免除。除非员工被依法解除劳动合同或达到法定退休年龄等特定情形，否则用人单位应继续履行缴纳义务。

2. 公安机关调查行为的影响：

   • 公安机关在调查员工偷盗行为时，其调查行为主要针对的是员工的违法犯罪行为，与员工的五险一金缴纳无直接联系。
   • 公安机关无权直接干预或决定用人单位是否停付员工的五险一金。如果用人单位因员工涉嫌违法犯罪而擅自停付五险一金，可能构成违法行为，员工有权向相关部门投诉或寻求法律救济。

3. 可能的法律后果：

   • 如果用人单位擅自停付员工的五险一金，可能面临劳动行政部门的处罚，包括责令限期缴纳、加收滞纳金等。
   • 员工也有权要求用人单位补缴欠缴的社会保险费，并可能因此要求用人单位支付经济补偿或赔偿金。

法律建议：

• 对于用人单位：在员工涉嫌违法犯罪的情况下，应继续履行五险一金的缴纳义务，不得擅自停付。如需解除与员工的劳动合同，应依法进行，并确保解除程序的合法性和合规性。
• 对于员工：如发现用人单位擅自停付五险一金，应及时向劳动行政部门投诉或寻求法律救济，维护自己的合法权益。

特殊情况说明：

• 如果员工因涉嫌违法犯罪被依法采取强制措施（如拘留、逮捕等），且在此期间无法正常工作，用人单位与员工之间的劳动关系可能因此受到影响。但即便如此，用人单位也应根据相关法律法规和劳动合同的约定，妥善处理五险一金的缴纳问题，避免因此产生法律纠纷。

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