农业灌溉水资源费征收是否合法，需结合具体情况判断，但总体而言，在符合法律法规和政策规定的前提下，其征收是合法的。以下从不同角度进行详细分析：

一、政策依据与合法性基础

农业灌溉水资源费的征收，通常依据国家相关法律法规及地方具体实施办法进行。例如，《水利工程供水价格管理办法》等法规，为水资源的合理调配和有偿使用提供了法律依据。这些法规明确了水资源属于国家所有，使用水资源应当缴纳费用，以促进水资源的节约和保护。因此，在符合国家法律法规和地方政策规定的前提下，农业灌溉水资源费的征收是合法的。

二、征收主体与程序合法性

1. 征收主体：农业灌溉水资源费一般由灌区管理局、水利管理站等负责水利工程管理的单位或机构承担。这些单位或机构具备征收水资源费的法定职责和权限。
2. 征收程序：征收过程应遵循法定程序，包括用水量计量、费用计算、通知缴纳、开具票据等环节。确保征收程序的合法性和规范性，是保障水资源费征收合法性的重要方面。

若征收主体不具备法定职责，或征收程序存在违法违规行为，则农业灌溉水资源费的征收可能不合法。

三、征收原则与合理性

农业灌溉水资源费的征收应遵循合理性、公平性和可持续性原则。具体来说：

1. 合理性：水资源费应基于实际用水量和水资源成本进行定价，确保费用与水资源的使用量相匹配。
2. 公平性：考虑不同用水户的用水量、性质等因素，确保水资源费的负担公平合理。
3. 可持续性：通过征收水资源费，促进节水型农业的发展，保障水资源的长期利用。

若水资源费的征收违反了上述原则，如定价过高、负担不公等，则可能引发合法性争议。

四、优惠与补贴政策

为了减轻农民负担，促进农业发展，国家和地方通常出台一系列优惠与补贴政策。例如：

1. 农业用水优惠：农业用水价格通常低于工业和生活用水价格，以减轻农民的经济负担。
2. 节水奖励：对采用高效节水技术的农户给予补贴或奖励，鼓励节水行为。
3. 困难补助：对经济困难的农户提供水费减免或补助，保障其基本用水需求。

这些优惠与补贴政策的实施，有助于增强农业灌溉水资源费征收的合法性和合理性。

五、监督与公开机制

为了确保农业灌溉水资源费征收的合法性和透明度，相关部门应加强对水费征收和使用情况的监督。具体来说：

1. 加强监督：相关部门应定期对水费征收和使用情况进行检查，防止乱收费和资金挪用等行为。
2. 审计与透明：定期对水费征收和使用情况进行审计，并及时公布审计结果，接受社会监督。

若缺乏有效的监督与公开机制，则可能引发对农业灌溉水资源费征收合法性的质疑。

法律建议

1. 了解政策规定：农民和用水户应了解国家及地方关于农业灌溉水资源费征收的政策规定，确保自身权益不受侵害。
2. 监督征收过程：用水户有权监督水资源费的征收过程，确保征收主体、程序、原则等符合法律法规和政策规定。
3. 维护合法权益：若发现农业灌溉水资源费征收存在违法违规行为，用水户可通过合法途径维护自身权益，如向相关部门投诉、举报等。

若您对农业灌溉水资源费征收的合法性存在疑问，或遇到相关法律问题，可直接向我咨询，我将为您提供专业的法律意见和帮助。