在仲裁阶段仅主张确认劳动关系，诉讼阶段一般不可以直接主张经济补偿金，但存在例外情形。以下从不同角度为你详细分析：

常规情况：仲裁与诉讼请求需具有关联性

从仲裁与诉讼的衔接程序来看，仲裁是诉讼的前置程序，且诉讼阶段原则上应围绕仲裁请求进行。在仲裁阶段仅主张确认劳动关系，意味着仲裁机构仅会对双方是否存在劳动关系这一事项进行审理和裁决。而经济补偿金的请求通常与劳动关系的解除原因、工作年限、工资标准等因素紧密相关。若在仲裁阶段未提出经济补偿金的请求，在诉讼阶段直接提出，可能会因超出仲裁请求范围，导致法院在审理时面临程序上的障碍。因为法院在审理劳动争议案件时，一般会尊重仲裁阶段的审理范围和结果，避免出现“仲裁不审、诉讼审”的情况，以保证司法程序的连贯性和稳定性。

例外情形：基于新事实或新理由提出

如果存在一些新的事实或理由，使得经济补偿金的请求与仲裁阶段确认劳动关系的请求产生了合理的关联，那么在诉讼阶段提出经济补偿金的请求可能会被法院受理。例如，在仲裁阶段确认劳动关系后，用人单位在仲裁裁决生效后，以不合理的理由解除了与劳动者的劳动关系，此时劳动者在诉讼阶段主张经济补偿金就有了新的事实依据。因为用人单位的解除行为是在仲裁阶段之后发生的，属于新的事实，劳动者基于此新事实主张经济补偿金，与仲裁阶段确认劳动关系的请求存在逻辑上的延续性，法院可能会允许劳动者在诉讼阶段提出该请求。

法律建议

1. 尽量在仲裁阶段全面主张权利：为了避免诉讼阶段可能面临的程序障碍，劳动者在申请仲裁时，应尽量全面地考虑自己的权益，将可能涉及到的请求，如经济补偿金、加班费、未签劳动合同的双倍工资等一并主张。这样可以一次性解决纠纷，减少诉讼成本和时间成本。
2. 及时收集新证据：如果在仲裁阶段后出现了新的事实或理由，劳动者应及时收集相关证据，如用人单位的解除通知、工资发放记录、考勤记录等，以证明自己主张经济补偿金的合理性。在诉讼阶段，这些新证据将成为支持自己请求的重要依据。
3. 咨询专业律师：劳动争议案件涉及的法律问题较为复杂，每个案件的具体情况也各不相同。如果你在仲裁或诉讼过程中遇到问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议和解决方案。

总之，在处理劳动争议案件时，要充分了解仲裁和诉讼的程序规则，合理主张自己的权利，以维护自己的合法权益。