主张经济补偿金后，并不影响申请确认劳动关系。这两者并不冲突，下面我为你详细解释：

首先，主张经济补偿金通常是在劳动关系已经存在，并且因为某种原因（如解雇、合同终止等）需要终止或解除时，劳动者根据法律规定向用人单位主张的一种经济补偿。这一行为的前提是劳动关系的存在。

其次，申请确认劳动关系则是在劳动关系存在争议或不明确时，通过法律途径来确认劳动者与用人单位之间是否存在劳动关系。这通常发生在劳动关系的认定存在疑问，或者需要明确劳动关系的起始、终止时间等情况下。

从法律角度来看，主张经济补偿金和申请确认劳动关系是两个独立的法律行为，它们之间并没有直接的因果关系或排斥关系。也就是说，即使你已经主张了经济补偿金，你仍然有权申请确认劳动关系；同样，即使你申请了确认劳动关系，也不妨碍你后续主张经济补偿金。

因此，如果你与用人单位之间就劳动关系的存在或具体内容存在争议，你可以依法申请确认劳动关系。同时，如果因为劳动关系的终止或解除而需要主张经济补偿金，你也可以依法进行主张。两者并不冲突，也不会相互影响。

希望这个解释能帮到你。如果你还有其他关于劳动工伤或劳动仲裁的问题，欢迎随时向我咨询。